More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2309 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2309  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase coupling protein  100 
 
 
183 aa  377  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320999  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6112  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  89.62 
 
 
186 aa  338  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980333  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2167  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  61.88 
 
 
179 aa  211  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5076  flavin reductase domain-containing protein  60.61 
 
 
175 aa  203  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848453  normal  0.150836 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0316  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  62.89 
 
 
180 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3609  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  58.24 
 
 
181 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537664  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2506  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  58.24 
 
 
216 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64515  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5345  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  60.62 
 
 
181 aa  198  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0297424  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3911  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  57.65 
 
 
181 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5089  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  60.25 
 
 
184 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3515  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  60 
 
 
181 aa  195  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.440753  normal  0.0189937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0635  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  56.02 
 
 
171 aa  191  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543019  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2356  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  57.62 
 
 
165 aa  184  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2452  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  57.62 
 
 
165 aa  184  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1639  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  57.62 
 
 
165 aa  184  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10990  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  50 
 
 
170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.699106  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  49.38 
 
 
170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04221  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  51.88 
 
 
170 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4575  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  51.88 
 
 
170 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04187  hypothetical protein  51.88 
 
 
170 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3711  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  51.88 
 
 
170 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.390593  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4881  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  51.88 
 
 
170 aa  181  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1193  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  53.75 
 
 
170 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1208  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  53.75 
 
 
170 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1162  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  53.75 
 
 
170 aa  177  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444908  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1057  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  53.75 
 
 
170 aa  177  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1173  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  53.12 
 
 
170 aa  174  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  46.84 
 
 
164 aa  153  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1819  flavin reductase domain-containing protein  46.2 
 
 
175 aa  150  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.988242  hitchhiker  0.00551903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  48.21 
 
 
176 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2213  flavin reductase domain-containing protein  47.4 
 
 
165 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  45.28 
 
 
164 aa  149  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01010  predicted oxidoreductase, flavin:NADH component  45.28 
 
 
164 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  45.28 
 
 
164 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1122  putative flavin reductase rutF  45.28 
 
 
164 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  45.28 
 
 
164 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  45.28 
 
 
164 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1125  putative flavin reductase rutF  45.28 
 
 
164 aa  149  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1180  flavin reductase-like, FMN-binding  46.54 
 
 
165 aa  148  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669714  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  45.4 
 
 
178 aa  147  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  44.65 
 
 
164 aa  147  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  50 
 
 
181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  45.1 
 
 
180 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.5 
 
 
180 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  43.31 
 
 
167 aa  141  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  44.05 
 
 
202 aa  141  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  47.77 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.86 
 
 
201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2464  flavin reductase-like, FMN-binding  44.16 
 
 
170 aa  137  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00765  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  42.58 
 
 
176 aa  137  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0712  flavin reductase-like, FMN-binding  42.33 
 
 
169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195047  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  45.51 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.16 
 
 
172 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  44.03 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1079  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.76 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155431  normal  0.0275132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.52 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  44.94 
 
 
171 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.56 
 
 
181 aa  127  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.88 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.45 
 
 
204 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6513  flavin reductase domain-containing protein  42.59 
 
 
168 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.226456  normal  0.292834 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4906  flavin reductase-like, FMN-binding  41.98 
 
 
193 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  38.1 
 
 
164 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3257  flavin reductase domain-containing protein  41.98 
 
 
193 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1225  flavin:NADH reductase  41.61 
 
 
147 aa  120  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00730125  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1292  monooxygenase, putative  37.57 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  38.71 
 
 
210 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4430  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.91 
 
 
170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.26 
 
 
175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3806  flavin reductase domain-containing protein  41.1 
 
 
171 aa  114  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  35.48 
 
 
196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  34.84 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1584  flavin reductase-like, FMN-binding  38.75 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2123  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.64 
 
 
164 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  32.68 
 
 
166 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  38.15 
 
 
175 aa  101  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  34.64 
 
 
174 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.64 
 
 
164 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2341  flavin reductase-like, FMN-binding  32.3 
 
 
165 aa  96.3  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236422  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  31.68 
 
 
166 aa  94.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2423  flavoprotein oxidoreductase  37.14 
 
 
150 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.284229  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.31 
 
 
170 aa  92.8  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5217  flavoprotein oxidoreductase  33.78 
 
 
149 aa  92.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
183 aa  91.3  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  31.17 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  30.97 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.29 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  32.72 
 
 
167 aa  89.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  31.82 
 
 
156 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  35.92 
 
 
183 aa  89  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  34.42 
 
 
186 aa  88.2  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5433  flavin reductase-like, FMN-binding  30.54 
 
 
174 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  31.87 
 
 
185 aa  84.3  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2035  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.77 
 
 
166 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02120  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.26 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  33.99 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  31.29 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.68 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1705  flavin reductase domain-containing protein  34.67 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  29.56 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>