40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3828 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3828  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2970  hypothetical protein  40.4 
 
 		 342 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.145955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  37.01 
 
 		 1195 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  27.95 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  29.61 
 
 		 345 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  29.52 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  28.87 
 
 		 247 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  26.38 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0733  hypothetical protein  24.24 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.97575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  29.63 
 
 		 793 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  26.92 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  24.73 
 
 		 861 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  29.91 
 
 		 773 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  30.56 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  37.39 
 
 		 843 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  43.68 
 
 		 792 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  47.44 
 
 		 783 aa  53.1  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  22.04 
 
 		 875 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1099  hypothetical protein  21.01 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  35.51 
 
 		 801 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  27.09 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  28.52 
 
 		 803 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  27.18 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  32.43 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  22.3 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  31.62 
 
 		 795 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  27.95 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  26.49 
 
 		 329 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  35.19 
 
 		 809 aa  46.2  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1913  hypothetical protein  34.52 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  43.28 
 
 		 854 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  33.64 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  26.01 
 
 		 447 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  32.35 
 
 		 795 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3537  hypothetical protein  29 
 
 		 333 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  22.38 
 
 		 862 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0043  hypothetical protein  35.05 
 
 		 314 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274939  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  32.43 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  22.97 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  26.32 
 
 		 318 aa  43.1  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>