35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4279 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0150  spermidine synthase-like  56.45 
 
 		 812 aa  843    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4279  hypothetical protein  100 
 
 		 818 aa  1612    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2865  hypothetical protein  51.73 
 
 		 819 aa  745    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0368958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3330  hypothetical protein  37.23 
 
 		 783 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0454731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0453  hypothetical protein  32.57 
 
 		 828 aa  357  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0793  hypothetical protein  32.2 
 
 		 827 aa  342  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.526313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4224  hypothetical protein  31.45 
 
 		 821 aa  338  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.965892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2791  hypothetical protein  30.02 
 
 		 806 aa  275  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2180  hypothetical protein  31.19 
 
 		 889 aa  206  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.786018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2931  hypothetical protein  27.05 
 
 		 766 aa  152  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0187375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3413  Spermidine synthase-like protein  34.53 
 
 		 681 aa  72.4  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.730337  normal  0.555353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5063  Spermidine synthase-like protein  25.97 
 
 		 692 aa  72.4  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  27.46 
 
 		 837 aa  63.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  24.65 
 
 		 1017 aa  57.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  30.83 
 
 		 284 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  24.67 
 
 		 991 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  25.83 
 
 		 1078 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1079 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  32.37 
 
 		 674 aa  52  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  28.35 
 
 		 279 aa  51.6  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  25.32 
 
 		 1078 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2591  hypothetical protein  35.71 
 
 		 106 aa  50.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000151493  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  39.55 
 
 		 903 aa  49.3  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  28.4 
 
 		 982 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  27.98 
 
 		 678 aa  47.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  31.63 
 
 		 280 aa  47.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  22.95 
 
 		 983 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  30.61 
 
 		 280 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  30.61 
 
 		 280 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  29.84 
 
 		 279 aa  45.8  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  25.41 
 
 		 304 aa  45.4  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0159  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  45.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0669306  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  23.7 
 
 		 782 aa  45.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  30.83 
 
 		 283 aa  44.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  30.36 
 
 		 283 aa  44.3  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>