36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3738 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3738  hypothetical protein  100 
 
 		 540 aa  1076    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  26.67 
 
 		 824 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2014  hypothetical protein  25.7 
 
 		 510 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.979854  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3387  hypothetical protein  26.64 
 
 		 715 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000202252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2736  hypothetical protein  29.44 
 
 		 756 aa  75.1  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3962  hypothetical protein  27.51 
 
 		 671 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.443491 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1293  hypothetical protein  26.91 
 
 		 629 aa  67  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1262  hypothetical protein  26.79 
 
 		 629 aa  66.6  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1025  hypothetical protein  26.79 
 
 		 629 aa  66.6  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  46.88 
 
 		 877 aa  62.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  42.11 
 
 		 887 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  36 
 
 		 784 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  36 
 
 		 784 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  36 
 
 		 784 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3052  putative membrane protein, phage K related  23.76 
 
 		 574 aa  55.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00556585  hitchhiker  0.0000266051 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3161  hypothetical protein  26.05 
 
 		 828 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  37.08 
 
 		 817 aa  54.7  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  21.53 
 
 		 762 aa  54.3  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2752  TP901 family phage tail tape measure protein  26.12 
 
 		 598 aa  54.3  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  25.9 
 
 		 598 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1626  hypothetical protein  21.89 
 
 		 925 aa  50.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4487  TP901 family phage tail tape measure protein  26.44 
 
 		 666 aa  50.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108183  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  31.5 
 
 		 825 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  25.7 
 
 		 1216 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  36.36 
 
 		 814 aa  47  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  33.33 
 
 		 920 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  37.88 
 
 		 1030 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  49.06 
 
 		 739 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1646  hypothetical protein  25.42 
 
 		 623 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327516  normal  0.459319 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.56 
 
 		 959 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  27.69 
 
 		 919 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  26.42 
 
 		 1297 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  25.45 
 
 		 743 aa  44.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1041  phage tail tape measure family protein  25.41 
 
 		 605 aa  44.3  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1157  TMP  34.48 
 
 		 590 aa  43.9  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  27.54 
 
 		 863 aa  43.5  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>