More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2205 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2205  PfkB  100 
 
 		 327 aa  643    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.503057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  38.38 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  42.05 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  39.47 
 
 		 307 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  34.54 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  40.13 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  39.8 
 
 		 305 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  42.14 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  40.92 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  43.42 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  35.25 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  42.67 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  43.67 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  42.33 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  43.67 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  35.35 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  37.13 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  39.6 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  39.87 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  35 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  39.09 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  37.29 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  41.46 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  37.29 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  37.29 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  43.45 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  43.38 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  38.16 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  38.36 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  41.47 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  41.58 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  38.94 
 
 		 305 aa  175  9e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  42.9 
 
 		 302 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5194  ribokinase  39.14 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  38.65 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  37.78 
 
 		 317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  36.42 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  38.74 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  33.66 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  38.69 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  42.24 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  36.3 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  36.73 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  36.75 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  35.18 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  36.08 
 
 		 298 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  36.05 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  38.36 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  37.7 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  36.99 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  37.7 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  37.7 
 
 		 314 aa  169  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  38.36 
 
 		 309 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  36.08 
 
 		 298 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  38.36 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  37.7 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  36.08 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  38.36 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  37.7 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  37.7 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  37.7 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  38.36 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  37.7 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  38.36 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  35.74 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  36.08 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  36.08 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  36.08 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  37.71 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  35.74 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  38.62 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  37.38 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  40.4 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  35.55 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  32.56 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  32.89 
 
 		 303 aa  165  9e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  37.01 
 
 		 403 aa  165  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  40 
 
 		 314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  33.44 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  37.83 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  43.14 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  37.38 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  36.21 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  42.91 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  34.77 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  34.77 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  39.38 
 
 		 320 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  40.13 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1401  ribokinase  40.26 
 
 		 325 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.033164  normal  0.166986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  40.8 
 
 		 304 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  39.38 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  37.83 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  34.11 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  33.92 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  34.45 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  38.44 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  34.45 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  36.33 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  35.28 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  38.05 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>