More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2054 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2054  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 226 aa  453  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.0850915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  43.7 
 
 		 240 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  43.7 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  43.7 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  41.35 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1043  NUDIX hydrolase  51.83 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1713  NUDIX hydrolase  44.24 
 
 		 203 aa  169  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108614  normal  0.043111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5012  NUDIX hydrolase  53.09 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0933  hypothetical protein  55.33 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1198  NUDIX hydrolase  47.47 
 
 		 201 aa  141  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.639623  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4339  NUDIX hydrolase  49.22 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.975502  normal  0.0924805 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4234  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0154099  normal  0.59978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4064  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 206 aa  127  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.120697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2649  NUDIX hydrolase  46.79 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0213367  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  50.51 
 
 		 168 aa  92  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  50.51 
 
 		 168 aa  92  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  48 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  41.78 
 
 		 199 aa  88.2  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  46.32 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  46.08 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 		 193 aa  85.1  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  47.47 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  43.16 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  41.75 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2628  NUDIX hydrolase  43.81 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  31.28 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  41.43 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  44.79 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  28.35 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  38.73 
 
 		 267 aa  75.1  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  35.57 
 
 		 199 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  35.57 
 
 		 199 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  35.57 
 
 		 199 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  37.16 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  42.72 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  40.21 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  39.42 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  43.88 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.42 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.42 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.42 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  40.17 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.42 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  36.91 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  43.88 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  33.77 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  41.75 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  42.27 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  41.75 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  42.27 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  29.71 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  45.83 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  35.97 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  42.72 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  42.27 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  42.86 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  43 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  42.27 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  43.88 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  35.46 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  31.91 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  40.4 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  42.27 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  35.95 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>