More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1963 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
409 aa  837    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  95.6 
 
 
409 aa  805    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  81.42 
 
 
411 aa  677    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  73.01 
 
 
394 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  75.4 
 
 
394 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  75.13 
 
 
394 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  74.6 
 
 
394 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  74.6 
 
 
394 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  74.6 
 
 
394 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  75.94 
 
 
394 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  75.94 
 
 
394 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  75.67 
 
 
394 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4911  glycosyl transferase group 1  74.87 
 
 
394 aa  551  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527182  hitchhiker  0.000729533 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  75.4 
 
 
394 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  52.67 
 
 
392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  52.23 
 
 
390 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  44.06 
 
 
400 aa  320  3e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  45.09 
 
 
378 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  47.12 
 
 
381 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  39.79 
 
 
386 aa  254  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  33.61 
 
 
379 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
375 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
376 aa  104  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
398 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  34.06 
 
 
406 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
369 aa  100  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
403 aa  99.8  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
382 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
372 aa  99  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.09 
 
 
419 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
378 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
394 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
390 aa  96.7  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 
386 aa  96.3  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
393 aa  96.3  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.05 
 
 
396 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  34.73 
 
 
390 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
425 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
370 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 
401 aa  93.2  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
382 aa  92.8  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
385 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
370 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
408 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
417 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
370 aa  91.3  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
453 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
369 aa  91.3  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  35.32 
 
 
370 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3289  putative LPS biosynthesis-related protein  34.3 
 
 
358 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502045  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  33.48 
 
 
403 aa  90.5  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
389 aa  90.1  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  30.22 
 
 
404 aa  90.1  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  34.73 
 
 
370 aa  90.1  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
377 aa  89.7  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1461  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
362 aa  90.1  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
398 aa  90.1  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  29.74 
 
 
416 aa  89.7  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
424 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
357 aa  89.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
412 aa  89.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
370 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
376 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  31.64 
 
 
430 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
402 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
391 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 
401 aa  88.2  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
400 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 
405 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
372 aa  87.8  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3580  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
373 aa  87.4  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.874879  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  30.15 
 
 
393 aa  87.4  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 
374 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  35.64 
 
 
370 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  30.58 
 
 
379 aa  86.3  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
407 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  29.63 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  30.62 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 
346 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
369 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 
346 aa  85.9  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
899 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
384 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
378 aa  84.7  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1977  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.665081 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>