37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1785 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 311 aa  624  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  85.36 
 
 		 320 aa  484  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  53.58 
 
 		 322 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  54.81 
 
 		 300 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  48.66 
 
 		 327 aa  265  8e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  51.16 
 
 		 299 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  51.16 
 
 		 299 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  52 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  48.76 
 
 		 305 aa  252  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  52.41 
 
 		 300 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  43.47 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  43.47 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  43.47 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  39.62 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  41.58 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  61.7 
 
 		 383 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  61.7 
 
 		 379 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  61.7 
 
 		 379 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1812  putative transmembrane anti-sigma factor  60.67 
 
 		 301 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  41 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  41.25 
 
 		 276 aa  175  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  33.99 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  53.42 
 
 		 228 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  32.66 
 
 		 265 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  32.24 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  35.96 
 
 		 260 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  32.34 
 
 		 278 aa  139  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  48.53 
 
 		 253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  46.32 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  46.27 
 
 		 221 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  47.66 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  30.58 
 
 		 259 aa  105  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  31.53 
 
 		 276 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  26.79 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  26.79 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  26.79 
 
 		 255 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1210  anti-sigma factor  40.62 
 
 		 107 aa  42.7  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>