47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0480 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  870    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  81.92 
 
 		 433 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  63.23 
 
 		 409 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  51.03 
 
 		 457 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2826  hypothetical protein  50.25 
 
 		 427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.378157 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  53.67 
 
 		 418 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  53.37 
 
 		 418 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  53.37 
 
 		 435 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  52.97 
 
 		 439 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  53.2 
 
 		 426 aa  345  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  54.25 
 
 		 460 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  53.87 
 
 		 443 aa  342  9e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  66.36 
 
 		 439 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  65.91 
 
 		 439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  65.91 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  65.91 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  65.91 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  65.91 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  46.98 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  45.05 
 
 		 360 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  44.59 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  41.71 
 
 		 326 aa  166  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0083  hypothetical protein  41.15 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0961  hypothetical protein  34.3 
 
 		 324 aa  143  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.78766  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  33.68 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0301  hypothetical protein  30 
 
 		 396 aa  103  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0444  hypothetical protein  27.93 
 
 		 393 aa  100  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0990  hypothetical protein  33.33 
 
 		 391 aa  100  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3060  hypothetical protein  33.51 
 
 		 257 aa  93.6  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0438  hypothetical protein  28.86 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137031  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0447  hypothetical protein  28.86 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0612  hypothetical protein  31.07 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 377 aa  82.8  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0740  hypothetical protein  29.11 
 
 		 231 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3631  putative proline-rich signal peptide protein  32.74 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.237393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2664  hypothetical protein  26.07 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  27.27 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3160  hypothetical protein  27.67 
 
 		 324 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  30.13 
 
 		 244 aa  57  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1825  hypothetical protein  27.54 
 
 		 245 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0171796  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  27.61 
 
 		 238 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  29.46 
 
 		 238 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0595  hypothetical protein  26.7 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  27.34 
 
 		 256 aa  46.2  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  27.34 
 
 		 256 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2619  hypothetical protein  27.39 
 
 		 254 aa  44.3  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  25.66 
 
 		 238 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>