More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6090 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6090  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.574363 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5110  extracellular solute-binding protein  41.8 
 
 
279 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539737  hitchhiker  0.00536253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1819  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  40.52 
 
 
275 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309777  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4844  extracellular solute-binding protein family 3  40.89 
 
 
275 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  0.095648 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5967  ABC-type amino acid transport/signal transduction periplasmic protein  41.15 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1879  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.93 
 
 
281 aa  192  6e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1953  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.93 
 
 
281 aa  192  8e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450219  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0716  extracellular solute-binding protein  42.13 
 
 
272 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6445  extracellular solute-binding protein family 3  36.07 
 
 
275 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0216332 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4558  extracellular solute-binding protein  39.42 
 
 
289 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.776949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1064  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.91 
 
 
289 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00655066  normal  0.28594 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4637  extracellular solute-binding protein family 3  35.84 
 
 
275 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350827  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1147  extracellular solute-binding protein  38.2 
 
 
280 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.421653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1295  extracellular solute-binding protein  37.89 
 
 
292 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.914061  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02131  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  34.55 
 
 
283 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0156  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0415  ABC transporter extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 
276 aa  142  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  31.95 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  29.74 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 
254 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2658  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.4 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  30.57 
 
 
246 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
260 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 
252 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 
277 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.09 
 
 
250 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.09 
 
 
250 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.09 
 
 
250 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.92 
 
 
250 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  27.88 
 
 
264 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.66 
 
 
253 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.54 
 
 
259 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
246 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  31.54 
 
 
259 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.54 
 
 
259 aa  99.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  31.54 
 
 
259 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.33 
 
 
251 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  31.41 
 
 
259 aa  99.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.66 
 
 
250 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.66 
 
 
250 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.66 
 
 
250 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.66 
 
 
250 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1330  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.35 
 
 
282 aa  99  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.54 
 
 
259 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.18 
 
 
259 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.18 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.5 
 
 
250 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.5 
 
 
250 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.29 
 
 
259 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  26.3 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  31.12 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  30 
 
 
268 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3874  extracellular solute-binding protein  31.45 
 
 
260 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 
249 aa  95.5  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  27.97 
 
 
502 aa  95.5  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 
259 aa  95.5  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 
259 aa  95.5  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  27.97 
 
 
502 aa  95.5  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.07 
 
 
250 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6320  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 
264 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0695145  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.94 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  24.91 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  27.78 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 
260 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  28.14 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  28.14 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0890  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.92 
 
 
363 aa  93.6  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  28.14 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1248  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.67 
 
 
324 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2408  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.25 
 
 
260 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  0.0134444 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1792  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  31.25 
 
 
260 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  28.14 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2404  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.25 
 
 
260 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.634533  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  28.93 
 
 
248 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5139  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
260 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.900284 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1090  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  31.67 
 
 
258 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  28.14 
 
 
266 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3018  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  31.67 
 
 
324 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.280802  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30 
 
 
266 aa  92.8  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1701  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.49 
 
 
243 aa  92.8  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6020  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
264 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4136  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.99 
 
 
260 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.502518  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 
253 aa  92.4  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 
266 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0747  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.67 
 
 
258 aa  92  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0988  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  31.67 
 
 
258 aa  92  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.310906  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1579  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  31.67 
 
 
258 aa  92  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1095  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  31.67 
 
 
258 aa  92  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1163  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.0605845 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0631  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.45 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00542513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.45 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.93 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2469  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.25 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571347 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0708  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 
264 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1187  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 
264 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.708736  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2314  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.83 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.626493 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0962  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  30.21 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  29.37 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2597  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.87 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144936  normal  0.532052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>