30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5751 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  100 
 
 
569 aa  1155    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  37.69 
 
 
387 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  36.02 
 
 
375 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  37.3 
 
 
407 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  25.98 
 
 
681 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  25.44 
 
 
681 aa  101  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  30.87 
 
 
358 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  28.53 
 
 
590 aa  98.2  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  29.45 
 
 
756 aa  96.3  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  24.15 
 
 
678 aa  95.5  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  30.7 
 
 
466 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  31.62 
 
 
367 aa  94.4  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  27.84 
 
 
362 aa  90.9  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  32.38 
 
 
421 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  29.31 
 
 
647 aa  87  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  28.32 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  26.36 
 
 
728 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  28.68 
 
 
759 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  26.94 
 
 
404 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6524  hypothetical protein  25.09 
 
 
454 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2188  hypothetical protein  32.89 
 
 
733 aa  58.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  30.05 
 
 
370 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  30.64 
 
 
464 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  26.73 
 
 
679 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  27.16 
 
 
717 aa  51.6  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  30.39 
 
 
587 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2139  ATPase-like protein  28.99 
 
 
642 aa  48.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.51863 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  32.14 
 
 
338 aa  45.8  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2616  AAA ATPase  29.78 
 
 
674 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  31.13 
 
 
275 aa  43.9  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>