36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4803 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  43.88 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  46.76 
 
 
328 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  38.04 
 
 
339 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  38.04 
 
 
339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  37.7 
 
 
360 aa  82.4  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  40.38 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  39.13 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  39.13 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  36.54 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  31.72 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  35.88 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  35.56 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  36.84 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  32.06 
 
 
307 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  32.06 
 
 
307 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  36.97 
 
 
324 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  36.97 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  39.08 
 
 
308 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3346  hypothetical protein  30.68 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  30.56 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0421  hypothetical protein  28.64 
 
 
211 aa  59.3  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.504733  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4588  hypothetical protein  32.21 
 
 
1010 aa  58.9  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200354  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1263  hypothetical protein  34.45 
 
 
244 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  35.24 
 
 
251 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  35.24 
 
 
251 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0116  hypothetical protein  26.73 
 
 
321 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933022  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0396  hypothetical protein  34.35 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0365  hypothetical protein  34.35 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  34.59 
 
 
294 aa  52.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0870  hypothetical protein  29.41 
 
 
1040 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.185589 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2215  hypothetical protein  23.5 
 
 
217 aa  49.7  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4184  hypothetical protein  28.66 
 
 
1067 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.485228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4301  hypothetical protein  33.03 
 
 
295 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  27.35 
 
 
274 aa  43.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1885  hypothetical protein  37.93 
 
 
323 aa  41.6  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>