More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0104 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 325 aa  671    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  87.69 
 
 		 325 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  87.85 
 
 		 321 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  76.38 
 
 		 326 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  76.38 
 
 		 326 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  76.38 
 
 		 326 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  77.61 
 
 		 326 aa  527  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  76.38 
 
 		 326 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  76.38 
 
 		 326 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  76.99 
 
 		 326 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  76.38 
 
 		 326 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  76.69 
 
 		 326 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  76.07 
 
 		 326 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  76.38 
 
 		 326 aa  524  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  76.38 
 
 		 326 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  76.07 
 
 		 326 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  75.77 
 
 		 336 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  57.59 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  54.8 
 
 		 336 aa  359  4e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  57.65 
 
 		 336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  55 
 
 		 335 aa  354  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  53.92 
 
 		 334 aa  348  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  51.9 
 
 		 326 aa  345  5e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3044  ATPase central domain-containing protein  75.36 
 
 		 207 aa  322  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3046  AAA ATPase, central region  81.58 
 
 		 119 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  39.02 
 
 		 524 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  32.91 
 
 		 397 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  32.91 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  32.91 
 
 		 441 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  32.37 
 
 		 406 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  32.37 
 
 		 406 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  34.52 
 
 		 396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4599  AAA ATPase  30.49 
 
 		 397 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  33.59 
 
 		 402 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0019  AAA ATPase central domain protein  32.06 
 
 		 367 aa  136  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  32.77 
 
 		 405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  30.79 
 
 		 439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  39.44 
 
 		 775 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  33.53 
 
 		 800 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  27.53 
 
 		 783 aa  106  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  33.96 
 
 		 793 aa  106  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  35.66 
 
 		 793 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  31.17 
 
 		 809 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  35 
 
 		 1104 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  34.21 
 
 		 813 aa  103  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03860  conserved hypothetical protein  35 
 
 		 1309 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  32.35 
 
 		 815 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  35.66 
 
 		 797 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  32.98 
 
 		 803 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  28.42 
 
 		 535 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3063  ATPase  31.03 
 
 		 528 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.454376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  35.93 
 
 		 801 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  34.84 
 
 		 768 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  37.06 
 
 		 932 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  35.66 
 
 		 775 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  30.89 
 
 		 856 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  34.57 
 
 		 835 aa  99.8  6e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2107  response regulator receiver protein  33.52 
 
 		 768 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  31.75 
 
 		 804 aa  99.4  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0952  ATP-dependent protease La  32.1 
 
 		 781 aa  99.4  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 815 aa  99.4  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  32.87 
 
 		 796 aa  98.6  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  34.04 
 
 		 797 aa  98.6  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  27.63 
 
 		 816 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  32.87 
 
 		 880 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  34.27 
 
 		 774 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  34.27 
 
 		 809 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 817 aa  98.2  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  26.83 
 
 		 808 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  25.81 
 
 		 779 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  35.21 
 
 		 812 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  30.38 
 
 		 936 aa  97.1  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  34.27 
 
 		 792 aa  97.4  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  35.21 
 
 		 810 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  30.38 
 
 		 936 aa  97.1  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  34.27 
 
 		 898 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  32.86 
 
 		 809 aa  97.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  38.19 
 
 		 807 aa  97.1  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  26.2 
 
 		 805 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  34.29 
 
 		 800 aa  97.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  34.29 
 
 		 800 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  30.33 
 
 		 805 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1387  peptidase S16, ATP-dependent protease La  31.93 
 
 		 772 aa  96.7  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3781  ATPase  30.54 
 
 		 538 aa  96.7  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  33.53 
 
 		 786 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  34.97 
 
 		 804 aa  96.7  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0112  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 820 aa  96.3  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.187598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  33.53 
 
 		 783 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1532  ATP-dependent protease La  34.75 
 
 		 797 aa  96.3  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.801288  normal  0.268359 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0470  hypothetical protein  36.62 
 
 		 827 aa  96.3  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0143  ATP-dependent protease La  33.13 
 
 		 794 aa  96.3  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  28.71 
 
 		 756 aa  95.9  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  34.51 
 
 		 816 aa  95.9  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  31.87 
 
 		 812 aa  95.9  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  28.71 
 
 		 787 aa  95.9  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  34.51 
 
 		 817 aa  95.9  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  34.51 
 
 		 797 aa  95.9  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  26.22 
 
 		 805 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  26.22 
 
 		 805 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0201  ATP-dependent protease La  34.42 
 
 		 815 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>