71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2211 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2211  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  100 
 
 		 500 aa  1002    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00497018  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0818  hypothetical protein  43.24 
 
 		 623 aa  94  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2433  treponemal membrane protein, putative  32.54 
 
 		 233 aa  92.4  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00220902  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1464  LysM domain-containing protein  44.07 
 
 		 229 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.026138  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2992  LysM domain/BON superfamily protein  38.82 
 
 		 149 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.021376 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3097  LysM domain/BON superfamily protein  38.82 
 
 		 149 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2908  LysM domain/BON superfamily protein  38.82 
 
 		 149 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2940  LysM domain/BON superfamily protein  38.82 
 
 		 149 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2975  LysM domain/BON superfamily protein  38.82 
 
 		 149 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.870465  normal  0.0673181 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  37.65 
 
 		 149 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.267708 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  51.79 
 
 		 219 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1358  peptidoglycan-binding LysM  42.37 
 
 		 230 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000598649  hitchhiker  5.9516e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1039  LysM domain-containing protein  48.89 
 
 		 243 aa  55.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000199986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2195  peptidoglycan-binding LysM  45.76 
 
 		 238 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000396131  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1869  peptidoglycan-binding LysM  53.33 
 
 		 367 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3907  LysM domain/BON superfamily protein  36.47 
 
 		 149 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.979345  normal  0.391605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5282  Peptidoglycan-binding LysM  37.04 
 
 		 552 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.772795 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3216  LysM domain/BON superfamily protein  36.47 
 
 		 149 aa  54.3  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02485  hypothetical protein  36.47 
 
 		 149 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1041  LysM domain/BON superfamily protein  36.47 
 
 		 149 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2945  LysM domain/BON superfamily protein  36.47 
 
 		 149 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2800  LysM domain/BON superfamily protein  36.47 
 
 		 149 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1018  Peptidoglycan-binding LysM  36.47 
 
 		 149 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02521  hypothetical protein  36.47 
 
 		 149 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2695  peptidoglycan-binding protein  53.33 
 
 		 440 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1352  peptidoglycan-binding LysM  53.33 
 
 		 440 aa  53.5  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.47776  normal  0.0441198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2328  peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 		 234 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000346433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2902  Peptidoglycan-binding LysM  45.76 
 
 		 230 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000393442  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2836  LysM domain/BON superfamily protein  31.68 
 
 		 148 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1323  Peptidoglycan-binding LysM  45.76 
 
 		 230 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.6395e-23 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0939  peptidoglycan-binding LysM  41.94 
 
 		 309 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.013426  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2091  hypothetical protein  46.67 
 
 		 167 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  50.85 
 
 		 234 aa  52  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1930  peptidoglycan-binding LysM  42.59 
 
 		 503 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0490055 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  40.35 
 
 		 651 aa  51.2  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5209  Peptidoglycan-binding LysM  45.1 
 
 		 511 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.263437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4742  peptidoglycan-binding LysM  45.1 
 
 		 511 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  48 
 
 		 339 aa  50.4  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  35.62 
 
 		 405 aa  50.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  45.61 
 
 		 546 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0258  LysM domain/BON superfamily protein  48.28 
 
 		 146 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0155386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0273  LysM domain/BON superfamily protein  48.28 
 
 		 146 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0972  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 546 aa  48.5  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0302  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.99 
 
 		 155 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 1051 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4246  Peptidoglycan-binding LysM  51.06 
 
 		 217 aa  47.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.995524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0490  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 291 aa  47.8  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  44.07 
 
 		 154 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 		 572 aa  47  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1623  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 232 aa  47  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000375126  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  47.27 
 
 		 168 aa  46.6  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4952  LysM domain/BON superfamily protein  46.55 
 
 		 150 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182933  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  40 
 
 		 145 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1112  peptidoglycan-binding LysM  48.89 
 
 		 322 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1024  Peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 680 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1766  hypothetical protein  38.64 
 
 		 531 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.905557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  44.07 
 
 		 638 aa  45.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2587  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  40 
 
 		 992 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 428 aa  44.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  35.29 
 
 		 145 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2244  hypothetical protein  45.45 
 
 		 156 aa  44.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  42.11 
 
 		 166 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  35.29 
 
 		 242 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0283  LysM domain/BON superfamily protein  43.4 
 
 		 146 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  41.82 
 
 		 256 aa  43.9  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  40 
 
 		 663 aa  43.9  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  41.38 
 
 		 158 aa  43.9  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000146101  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  37.93 
 
 		 1910 aa  43.5  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  35.59 
 
 		 389 aa  43.1  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0282  LysM domain/BON superfamily protein  36.47 
 
 		 146 aa  43.5  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  39.58 
 
 		 352 aa  43.1  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>