More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0392 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0392  formyl transferase domain protein  100 
 
 		 312 aa  642    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  34.55 
 
 		 319 aa  202  7e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1005  methionyl-tRNA formyltransferase  34.71 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00554605  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  30.84 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  32.9 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  33.98 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  32.69 
 
 		 317 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  34.23 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  34.73 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  33.23 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  33.23 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  34.3 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  33.23 
 
 		 318 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  32.04 
 
 		 318 aa  175  9e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  30.74 
 
 		 315 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  30.31 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  32.59 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  32.03 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  32.04 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  33.22 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  33.97 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  32.58 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  32.03 
 
 		 318 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  31.39 
 
 		 313 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  31.63 
 
 		 310 aa  172  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 309 aa  172  9e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  31.05 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  32.04 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  30.64 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  30.16 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  30.42 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  32.36 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  31.07 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  31.07 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  30.74 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  31.61 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  31.61 
 
 		 314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  31.61 
 
 		 314 aa  165  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  31.61 
 
 		 314 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  31.61 
 
 		 314 aa  165  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  31.61 
 
 		 314 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  31.61 
 
 		 314 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  30.74 
 
 		 320 aa  165  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  31.07 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  32.48 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  31.29 
 
 		 314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  31.48 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  30.3 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  33.99 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  30.97 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0373  methionyl-tRNA formyltransferase  34.44 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  30.74 
 
 		 315 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  31.61 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  30.97 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  31.07 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  30.1 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  30.74 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  30.74 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  30.74 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  30.74 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  30.74 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  31.73 
 
 		 316 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  30.87 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  29.87 
 
 		 314 aa  162  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  30.42 
 
 		 318 aa  162  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  32.04 
 
 		 318 aa  162  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  29.97 
 
 		 315 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  29.45 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0520  methionyl-tRNA formyltransferase  31.97 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  29.17 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  31.48 
 
 		 312 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  31.19 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  29.7 
 
 		 311 aa  159  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  30.74 
 
 		 315 aa  159  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  29.7 
 
 		 311 aa  159  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  30.23 
 
 		 311 aa  158  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 313 aa  158  9e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  30.39 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  30.74 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  29.7 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0597  methionyl-tRNA formyltransferase  30.23 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.411489  normal  0.365023 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  31.94 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0236  methionyl-tRNA formyltransferase  33.77 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0663  methionyl-tRNA formyltransferase  29.93 
 
 		 312 aa  156  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  28.21 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  29.26 
 
 		 313 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  30.12 
 
 		 333 aa  156  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  29.45 
 
 		 315 aa  156  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  29.45 
 
 		 315 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  29.45 
 
 		 315 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  31.51 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  28.16 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  31.21 
 
 		 319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0021  methionyl-tRNA formyltransferase  31.51 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.223082 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  28.48 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  30.82 
 
 		 312 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  29.17 
 
 		 359 aa  155  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  26.56 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  28.71 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  30.45 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>