More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1696 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1696  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 
405 aa  804    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320518  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1565  FMN-dependent family dehydrogenase  81.41 
 
 
407 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2038  FMN-dependent family dehydrogenase  81.41 
 
 
441 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2199  FMN-dependent family dehydrogenase  81.41 
 
 
441 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258331  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0604  putative L(+)-mandelate dehydrogenase  81.15 
 
 
441 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0813  FMN-dependent family dehydrogenase  80.68 
 
 
407 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2112  FMN-dependent family dehydrogenase  81.41 
 
 
447 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0717  FMN-dependent family dehydrogenase  81.41 
 
 
447 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0789  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  73.01 
 
 
431 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5798  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  66.93 
 
 
415 aa  498  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1661  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  64.57 
 
 
415 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1384  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  66.14 
 
 
411 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7084  dehydrogenase  60.79 
 
 
392 aa  474  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1708  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  59.74 
 
 
395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80121  normal  0.602463 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4469  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  59.58 
 
 
395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0508385 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0228  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  52.33 
 
 
439 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3410  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.09 
 
 
435 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194367  hitchhiker  0.0000661899 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2368  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.83 
 
 
412 aa  293  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2428  putative L-lactate dehydrogenase  45.36 
 
 
396 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1075  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  39.58 
 
 
399 aa  260  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5156  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.5 
 
 
415 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309178  normal  0.804479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1020  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.4 
 
 
372 aa  250  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168014  normal  0.586617 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5475  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.99 
 
 
396 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3912  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.69 
 
 
401 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2083  FMN-dependent dehydrogenase  36.39 
 
 
381 aa  242  7.999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.443709  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0136  S-mandelate dehydrogenase (MdlB)  39.25 
 
 
394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3706  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.08 
 
 
409 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.267728  normal  0.192703 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6258  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.67 
 
 
390 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3845  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  36.88 
 
 
397 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6402  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.07 
 
 
402 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3174  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.64 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.898854  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.28 
 
 
380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6162  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.81 
 
 
357 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3346  L-lactate dehydrogenase  37.89 
 
 
379 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.77 
 
 
381 aa  229  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3045  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.15 
 
 
374 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  33.6 
 
 
381 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  33.6 
 
 
381 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1959  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.59 
 
 
386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548069  normal  0.0478 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4075  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.89 
 
 
387 aa  226  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72179  normal  0.076317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0280  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  40.62 
 
 
410 aa  226  8e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0829  lactate dehydrogenase  34.76 
 
 
387 aa  225  9e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.967282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2487  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.76 
 
 
387 aa  225  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0268147  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2407  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.18 
 
 
406 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463668  normal  0.0231198 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0350  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.22 
 
 
387 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  36.24 
 
 
386 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2360  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.35 
 
 
379 aa  223  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5754  L-lactate dehydrogenase  34.57 
 
 
386 aa  222  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202266  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11900  L-lactate dehydrogenase (cytochrome) lldD2  39.45 
 
 
414 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.877385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3635  L-lactate dehydrogenase  38.1 
 
 
379 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  36.7 
 
 
386 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0758  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.61 
 
 
417 aa  222  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2875  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.95 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189587  normal  0.0992837 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3859  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.71 
 
 
390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1846  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.63 
 
 
382 aa  219  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3678  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.16 
 
 
383 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0259066  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3154  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.99 
 
 
381 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.83 
 
 
378 aa  219  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001223  L-lactate dehydrogenase  35.37 
 
 
379 aa  216  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.47 
 
 
379 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2879  L-lactate dehydrogenase  36.46 
 
 
383 aa  215  9e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4638  L-lactate dehydrogenase  38.01 
 
 
384 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76191  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2409  L-lactate dehydrogenase  36.36 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2506  L-lactate dehydrogenase  36.36 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3519  L-lactate dehydrogenase  36.48 
 
 
378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3298  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  34.2 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355781  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1050  L-lactate dehydrogenase  35.47 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1696  L-lactate dehydrogenase  36.36 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0334813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2651  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.2 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33860  L-lactate dehydrogenase  35.91 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.14557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2488  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.42 
 
 
385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0763521  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.77 
 
 
381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6013  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.14 
 
 
397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3141  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.02 
 
 
410 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4877  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.66 
 
 
379 aa  212  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.414226 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0948  L-lactate dehydrogenase  31.99 
 
 
390 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3942  L-lactate dehydrogenase  35.43 
 
 
396 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2398  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.6 
 
 
359 aa  212  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.940863  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4109  L-lactate dehydrogenase  35.53 
 
 
396 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0103  L-lactate dehydrogenase  35.53 
 
 
396 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03463  L-lactate dehydrogenase, FMN-linked  35.53 
 
 
396 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0100  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.53 
 
 
396 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03414  hypothetical protein  35.53 
 
 
396 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4031  L-lactate dehydrogenase  35.53 
 
 
396 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1654  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.9 
 
 
402 aa  211  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3817  L-lactate dehydrogenase  35.53 
 
 
396 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4978  L-lactate dehydrogenase  35.53 
 
 
396 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3343  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.94 
 
 
417 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2274  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.2 
 
 
369 aa  210  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12000  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  37.2 
 
 
418 aa  210  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1889  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.47 
 
 
402 aa  210  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0450886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5294  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.78 
 
 
391 aa  210  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1403  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.93 
 
 
368 aa  209  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00336342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0404  L-lactate dehydrogenase  36.46 
 
 
392 aa  209  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0804  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.81 
 
 
389 aa  209  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1331  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.96 
 
 
385 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5795  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.12 
 
 
383 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.821423 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1041  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.95 
 
 
458 aa  209  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3293  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.86 
 
 
403 aa  208  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  hitchhiker  0.00293755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0068  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.78 
 
 
382 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.368436  normal  0.0189918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>