43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2709 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 511 aa  1026    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  41.57 
 
 		 458 aa  266  8e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  33.33 
 
 		 474 aa  126  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 463 aa  123  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  28.54 
 
 		 472 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  28.54 
 
 		 472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  32.13 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  29.97 
 
 		 990 aa  109  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  29.22 
 
 		 966 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  30.14 
 
 		 978 aa  107  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  29.86 
 
 		 993 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  30.28 
 
 		 911 aa  90.9  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  29.11 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  29.71 
 
 		 535 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  41.67 
 
 		 1079 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  25.22 
 
 		 727 aa  73.6  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  31.01 
 
 		 505 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  40 
 
 		 1108 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  48.1 
 
 		 458 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  31.72 
 
 		 480 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0748  sporulation and cell division repeat-containing protein  22.27 
 
 		 835 aa  65.9  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.198292  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  28.15 
 
 		 545 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  26.98 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3328  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.67 
 
 		 588 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  37.04 
 
 		 313 aa  57  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  42.31 
 
 		 276 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  20.45 
 
 		 2449 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  34.57 
 
 		 380 aa  52  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2393  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.53 
 
 		 573 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0818028  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  31.79 
 
 		 307 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3559  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.65 
 
 		 585 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 299 aa  48.5  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4762  hypothetical protein  32.1 
 
 		 359 aa  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  35.16 
 
 		 328 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  29.63 
 
 		 341 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 328 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  25.55 
 
 		 470 aa  47.4  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0809  lytic transglycosylase, catalytic  37.7 
 
 		 303 aa  47  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1699  peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  27 
 
 		 587 aa  47.4  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0899262  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  30.86 
 
 		 347 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3058  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.5 
 
 		 578 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2420  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.6 
 
 		 586 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0202661  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  30.86 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.537476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>