84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1167 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1167  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  725    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6377  hypothetical protein  27.83 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.498537  normal  0.74546 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7989  NHL repeat containing protein  25.9 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.575818  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6158  hypothetical protein  24.62 
 
 		 335 aa  112  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1869  hypothetical protein  26.14 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3441  hypothetical protein  24.92 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.597257 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4252  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.6 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0312  hypothetical protein  27.62 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6734  hypothetical protein  24.29 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.745861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4601  hypothetical protein  23.26 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.16736 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6194  hypothetical protein  22.03 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209099  hitchhiker  0.000235981 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0079  hypothetical protein  22.67 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781813  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0062  hypothetical protein  22.63 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.61 
 
 		 752 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.85 
 
 		 601 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  22.22 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  23.73 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  21.03 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1698  hypothetical protein  20.25 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.555013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1535  putative surface antigen protein  19.06 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2034  hypothetical protein  20.25 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.571695  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  21.96 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.65 
 
 		 340 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.65 
 
 		 340 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.65 
 
 		 340 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.26 
 
 		 365 aa  53.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.19 
 
 		 377 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.02 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.08 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.35 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  28.1 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1502  NHL repeat containing protein  24.5 
 
 		 765 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.86 
 
 		 334 aa  50.1  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  20.28 
 
 		 345 aa  49.3  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.36 
 
 		 362 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1100  putative receptor  25.28 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.76 
 
 		 689 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.85 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1880  hypothetical protein  29.31 
 
 		 453 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  21.76 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1346  hypothetical protein  24.41 
 
 		 796 aa  47.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.390579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.51 
 
 		 366 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  18.88 
 
 		 312 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  21.34 
 
 		 580 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  23.74 
 
 		 1094 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0586  putative receptor  29.13 
 
 		 358 aa  46.6  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.4 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  20.47 
 
 		 1667 aa  46.2  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  19.9 
 
 		 479 aa  46.2  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  20.34 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1946  lipoprotein, putative  24.31 
 
 		 945 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.2 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2303  hypothetical protein  24.31 
 
 		 945 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4611  hypothetical protein  22.58 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1477  hypothetical protein  22.58 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.940326 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  23 
 
 		 810 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5134  hypothetical protein  28.04 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0254476  normal  0.895353 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  20.27 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.84 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2626  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.35 
 
 		 659 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  20.66 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.22 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5863  hypothetical protein  24 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.974206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  20.33 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.91 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  21.46 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.51 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3149  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  20.87 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0188  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.16 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.31 
 
 		 357 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.93 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.46 
 
 		 272 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  29.67 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7977  hypothetical protein  28.17 
 
 		 497 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37687  normal  0.148037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.84 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3533  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25 
 
 		 488 aa  43.5  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  20.69 
 
 		 314 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.41 
 
 		 328 aa  43.1  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.95 
 
 		 479 aa  42.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.26 
 
 		 329 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6217  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.24 
 
 		 829 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2432  hypothetical protein  22.22 
 
 		 340 aa  42.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.750639  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.5 
 
 		 318 aa  42.7  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>