66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18980 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_18980  von Willebrand factor type A-like protein  100 
 
 
331 aa  661    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136451  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3961  von Willebrand factor type A  45.05 
 
 
399 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2454  von Willebrand factor type A  40.06 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00561279 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35740  von Willebrand factor type A-like protein  43.43 
 
 
341 aa  209  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496633  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2127  von Willebrand factor type A  41.63 
 
 
317 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000421408 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3079  von Willebrand factor type A  38.94 
 
 
364 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0708582  hitchhiker  0.000000341622 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2370  von Willebrand factor, type A  39.48 
 
 
336 aa  155  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0710  von Willebrand factor type A domain protein  29.01 
 
 
371 aa  121  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.283279 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1985  hypothetical protein  33.33 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.184995  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  24.52 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0043  hypothetical protein  29.27 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  26.75 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  26.62 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  22.36 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  25.52 
 
 
335 aa  63.9  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  22.7 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  24.54 
 
 
319 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  25.08 
 
 
471 aa  57  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
517 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  23.18 
 
 
345 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  22.49 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  29.53 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0875  hypothetical protein  28.57 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134729  normal  0.367408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5542  hypothetical protein  25.63 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5250  hypothetical protein  25.63 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  27.38 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5161  hypothetical protein  25.63 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  30.97 
 
 
328 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  24.5 
 
 
334 aa  50.4  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  21.05 
 
 
317 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  25.09 
 
 
344 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  23.93 
 
 
342 aa  49.3  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  24.31 
 
 
601 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  24.37 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  25.09 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  25.74 
 
 
599 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  27.01 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  26.01 
 
 
377 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  27.78 
 
 
412 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  25 
 
 
337 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  26.7 
 
 
544 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  29.01 
 
 
343 aa  46.2  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
522 aa  46.2  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  23.78 
 
 
332 aa  46.6  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  27.94 
 
 
319 aa  45.8  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.41 
 
 
358 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  24.77 
 
 
530 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  29.41 
 
 
358 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  24.34 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  27.17 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  28.35 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  30.54 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  28.39 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  24.77 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  24.83 
 
 
336 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.61 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  25.86 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  27.57 
 
 
315 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  25.61 
 
 
356 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  27 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  29.92 
 
 
337 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  28.74 
 
 
315 aa  43.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  21.12 
 
 
338 aa  42.7  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  22.81 
 
 
336 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  24.24 
 
 
595 aa  42.4  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>