150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05170 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  100 
 
 		 251 aa  493  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.99 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  47.39 
 
 		 261 aa  194  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  46.94 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  46.61 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  46 
 
 		 249 aa  178  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  46 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  43.08 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  42 
 
 		 247 aa  165  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  41.37 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  36.29 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  36.29 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  33.47 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  38.25 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.45 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.51 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  37.75 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.43 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  40.16 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  34.68 
 
 		 251 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  33.87 
 
 		 254 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  37.8 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  38.31 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  35.63 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.48 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  35.48 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  38.1 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  38.1 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  38.06 
 
 		 247 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  36.29 
 
 		 251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  36.29 
 
 		 251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  36.29 
 
 		 251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  38.15 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  37.1 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  33.6 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  37.65 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  34.69 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  37.15 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  34.55 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  36.14 
 
 		 251 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  37.9 
 
 		 255 aa  142  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  43.81 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  36.99 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  35.86 
 
 		 250 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.96 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.96 
 
 		 258 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  36.69 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.06 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  36.03 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  35.42 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  35.51 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  32.39 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  38.57 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  38.57 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  38.57 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  35.34 
 
 		 256 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  34.68 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  38.25 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  39.29 
 
 		 247 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.58 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.2 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.46 
 
 		 253 aa  112  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.8 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  33.85 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5437  hypothetical protein  43.7 
 
 		 137 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01680  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.12 
 
 		 253 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576893  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1659  NmrA family protein  31.44 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  32.77 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  38.34 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  32.48 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.93 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4025  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.22 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.68 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  30.53 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2861  NmrA family protein  31.58 
 
 		 266 aa  72  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.28 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 		 309 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 		 435 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.79 
 
 		 291 aa  52.4  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.7 
 
 		 295 aa  52.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1265  hypothetical protein  26.97 
 
 		 432 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  26.86 
 
 		 341 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1264  hypothetical protein  25.66 
 
 		 432 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.86 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0749  putative NADH-flavin reductase  30.49 
 
 		 218 aa  50.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  27.75 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  28.22 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  26.17 
 
 		 211 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.19 
 
 		 320 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  26.4 
 
 		 317 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 		 299 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.527248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.01 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>