More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7333 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1821  AMP-dependent synthetase and ligase  70.16 
 
 
652 aa  931    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7333  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
650 aa  1321    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6450  AMP-dependent synthetase and ligase  51.41 
 
 
650 aa  634  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137108  hitchhiker  0.0000000000000110833 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1428  AMP-dependent synthetase and ligase  49.36 
 
 
640 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922087  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6401  AMP-dependent synthetase and ligase  49.36 
 
 
640 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172099  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  43.25 
 
 
642 aa  526  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2222  AMP-dependent synthetase and ligase  41.98 
 
 
641 aa  496  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1427  AMP-dependent synthetase and ligase  42.24 
 
 
663 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0770781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  39.21 
 
 
646 aa  474  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0926585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  38.39 
 
 
646 aa  474  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00809823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2566  putative acetoacetyl-CoA synthase  38.9 
 
 
646 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000120954 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2554  acetoacetyl-CoA synthase, putative  38.9 
 
 
646 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2333  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  38.9 
 
 
646 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2292  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  38.41 
 
 
646 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.365139  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2517  putative acetoacetyl-CoA synthase  39.06 
 
 
646 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2609  putative acetoacetyl-CoA synthase  38.9 
 
 
646 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2806  putative acetoacetyl-CoA synthase  39.5 
 
 
646 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.846139  hitchhiker  0.00209693 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2376  acetoacetyl-CoA synthase  38.9 
 
 
646 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.381353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2553  acetoacetyl-CoA synthase  38.9 
 
 
646 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7155  AMP-dependent synthetase and ligase  39.81 
 
 
668 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2113  AMP-dependent synthetase and ligase  40.69 
 
 
643 aa  444  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3467  AMP-dependent synthetase and ligase  39.76 
 
 
670 aa  442  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2788  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 
608 aa  422  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374642  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2583  AMP-dependent synthetase and ligase  34.99 
 
 
674 aa  400  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319993  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0166  AMP-dependent synthetase and ligase  41.88 
 
 
623 aa  398  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 
694 aa  395  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0990  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 
670 aa  385  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.274147  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2056  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 
663 aa  380  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0866  AMP-dependent synthetase and ligase  33.49 
 
 
641 aa  382  1e-104  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0265876 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 
608 aa  375  1e-102  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0200095  normal  0.25307 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  34.51 
 
 
670 aa  356  8.999999999999999e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  35.16 
 
 
650 aa  353  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  35.45 
 
 
653 aa  352  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  34.96 
 
 
650 aa  350  5e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  37.01 
 
 
654 aa  343  4e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  34.88 
 
 
655 aa  342  9e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  35.26 
 
 
638 aa  342  2e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  35.25 
 
 
658 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  35.66 
 
 
639 aa  341  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  34.8 
 
 
655 aa  336  7.999999999999999e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  35.2 
 
 
659 aa  334  2e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  32.72 
 
 
660 aa  335  2e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  33.22 
 
 
638 aa  335  2e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  35.01 
 
 
639 aa  333  4e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  34.91 
 
 
656 aa  333  9e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  34.42 
 
 
666 aa  332  1e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  33.33 
 
 
666 aa  330  5.0000000000000004e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  33.59 
 
 
667 aa  330  7e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  33.39 
 
 
666 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  33.39 
 
 
664 aa  327  4.0000000000000003e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  35.16 
 
 
668 aa  327  6e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  34.58 
 
 
644 aa  326  8.000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  32.31 
 
 
656 aa  326  1e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  35.81 
 
 
660 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  35.81 
 
 
660 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  33.33 
 
 
648 aa  324  3e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  35.81 
 
 
666 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  31.65 
 
 
667 aa  323  6e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  34.15 
 
 
658 aa  323  6e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2429  acetyl-coenzyme A synthetase  32.86 
 
 
631 aa  323  7e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  33.71 
 
 
653 aa  323  8e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  34.03 
 
 
649 aa  323  9.000000000000001e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  32.59 
 
 
636 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  32.11 
 
 
636 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  32.22 
 
 
657 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  35.18 
 
 
650 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  32.51 
 
 
667 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  32.87 
 
 
666 aa  321  3e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  34.7 
 
 
674 aa  320  6e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  33.98 
 
 
632 aa  320  7e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  32.27 
 
 
652 aa  319  7.999999999999999e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  35.33 
 
 
632 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  33.6 
 
 
651 aa  319  9e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  33.96 
 
 
670 aa  319  9e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  32.39 
 
 
667 aa  318  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  34.3 
 
 
664 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  35.33 
 
 
632 aa  319  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  35.24 
 
 
655 aa  318  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  34.48 
 
 
631 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  34.79 
 
 
656 aa  318  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  33.44 
 
 
655 aa  318  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  33.44 
 
 
655 aa  318  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  32.86 
 
 
632 aa  317  4e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  33.33 
 
 
635 aa  317  4e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  35.33 
 
 
631 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  34.28 
 
 
649 aa  317  5e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  33.28 
 
 
652 aa  317  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  33.6 
 
 
661 aa  317  6e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  34.96 
 
 
656 aa  316  8e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  33.89 
 
 
655 aa  316  9e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  34.82 
 
 
657 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  32.17 
 
 
663 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  33.98 
 
 
715 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  31.63 
 
 
652 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  31.68 
 
 
636 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  33.99 
 
 
663 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  36.93 
 
 
627 aa  314  2.9999999999999996e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  33.99 
 
 
664 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  35.11 
 
 
643 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  34.81 
 
 
660 aa  313  4.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>