More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1884 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
116 aa  234  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  92.24 
 
 
116 aa  217  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  91.38 
 
 
116 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  83.62 
 
 
116 aa  197  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  70.19 
 
 
115 aa  148  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  70.19 
 
 
115 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  70.19 
 
 
115 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  70.19 
 
 
115 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  70.19 
 
 
115 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  70.19 
 
 
115 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  70.19 
 
 
115 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  70.19 
 
 
115 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  70 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  74.73 
 
 
94 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  63.83 
 
 
105 aa  132  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  59.38 
 
 
103 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  65.62 
 
 
106 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  63.73 
 
 
110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  62.11 
 
 
117 aa  124  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
104 aa  122  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  61 
 
 
107 aa  122  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  57.89 
 
 
109 aa  120  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  56.73 
 
 
133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  57.45 
 
 
96 aa  115  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  56 
 
 
112 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  52.83 
 
 
121 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  61.05 
 
 
125 aa  110  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  56.38 
 
 
96 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  51.89 
 
 
121 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  55.1 
 
 
113 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  60.44 
 
 
116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  55.21 
 
 
121 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  52.13 
 
 
109 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 
103 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  49.54 
 
 
107 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  49.54 
 
 
107 aa  100  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  47.71 
 
 
109 aa  100  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
106 aa  97.1  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  51.65 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  47.06 
 
 
117 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  50.96 
 
 
141 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 
116 aa  93.6  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  51.65 
 
 
110 aa  93.6  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 
127 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  47.92 
 
 
117 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  48.94 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 
113 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  45.26 
 
 
114 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
114 aa  87.4  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 
142 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
114 aa  87  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 
119 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  47.31 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  53.25 
 
 
110 aa  86.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  44.66 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
115 aa  86.3  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  49.48 
 
 
119 aa  84.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4102  transcriptional regulator ArsR family  45.12 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00250446  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  46.51 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  47.71 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  45.35 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
122 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  41.9 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  45.05 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  44.33 
 
 
227 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  44.44 
 
 
118 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4378  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0649635  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4967  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4262  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  43.68 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  36.46 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  42.55 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
101 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  40.66 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  39.18 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3220  ArsR family transcriptional regulator  47.87 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 
121 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 
102 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
101 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  48.05 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  39.76 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>