More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1543 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4201  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  91.41 
 
 		 418 aa  751    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4312  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  94.03 
 
 		 420 aa  775    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1543  cytochrome c, class I  100 
 
 		 419 aa  854    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303209  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5887  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  94.03 
 
 		 419 aa  745    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  0.403041 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4418  cytochrome c, class I  94.75 
 
 		 419 aa  775    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3948  cytochrome c, class I  94.75 
 
 		 419 aa  775    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130568  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3851  cytochrome c, class I  93.79 
 
 		 420 aa  776    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585006  normal  0.540211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4954  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  74.94 
 
 		 420 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.0290114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1417  cytochrome c, class I  67.17 
 
 		 421 aa  548  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00268752  normal  0.0511274 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  53.59 
 
 		 411 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0979655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  52.66 
 
 		 415 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61130  putative c-type cytochrome  53.58 
 
 		 415 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00213286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1907  cytochrome c, class I  52.66 
 
 		 411 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.551897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3556  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.07 
 
 		 403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3798  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  50.93 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.679754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4232  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  48.91 
 
 		 403 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1632  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  48.66 
 
 		 403 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3169  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.64 
 
 		 494 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0153486  hitchhiker  0.0000801233 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1001  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.71 
 
 		 430 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.44 
 
 		 426 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0986  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.18 
 
 		 430 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0966  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.44 
 
 		 430 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0858  cytochrome c, class I  43.7 
 
 		 429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1104  cytochrome c, class I  43.86 
 
 		 416 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.07 
 
 		 442 aa  316  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  41.69 
 
 		 419 aa  298  9e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  40.45 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  40.45 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  40.45 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  40.45 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  40.45 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  40.45 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  40.45 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  40.2 
 
 		 432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.45 
 
 		 432 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.55 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  39.75 
 
 		 421 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  39.25 
 
 		 430 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.91 
 
 		 448 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  38.96 
 
 		 432 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  38.72 
 
 		 432 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.53 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  39.53 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  39.53 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  39.69 
 
 		 430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  39.69 
 
 		 430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.72 
 
 		 432 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.92 
 
 		 461 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  39.34 
 
 		 427 aa  273  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05464  cytochrome c  38.23 
 
 		 718 aa  272  9e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.01 
 
 		 432 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  39.01 
 
 		 432 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.17 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.6 
 
 		 723 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  38.9 
 
 		 430 aa  269  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.44 
 
 		 434 aa  269  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  39.26 
 
 		 428 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  39.23 
 
 		 430 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3842  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.73 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.55 
 
 		 426 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  38.74 
 
 		 407 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.42 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.68 
 
 		 461 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  39.59 
 
 		 438 aa  262  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.06 
 
 		 680 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  38.5 
 
 		 469 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  36.05 
 
 		 468 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0943  cytochrome c family protein  40.51 
 
 		 650 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0780  cytochrome c family protein  40.51 
 
 		 476 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00190536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  37.06 
 
 		 424 aa  256  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.4 
 
 		 424 aa  256  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0768  cytochrome c family protein  40.51 
 
 		 482 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00254  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  38.26 
 
 		 429 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  36.58 
 
 		 669 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.18 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.15 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.54 
 
 		 434 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.92 
 
 		 422 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  39.54 
 
 		 434 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  39.54 
 
 		 434 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.54 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.5 
 
 		 474 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  39.75 
 
 		 447 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  39.54 
 
 		 439 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  39.29 
 
 		 432 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  39.29 
 
 		 432 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.29 
 
 		 432 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.58 
 
 		 395 aa  249  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  39.07 
 
 		 432 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  41.01 
 
 		 473 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  39.33 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.33 
 
 		 444 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  38.06 
 
 		 437 aa  246  8e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1807  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.63 
 
 		 469 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000207286  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33640  dehydrogenase cytochrome c subunit  38.62 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  38 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2294  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  37.07 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1453  cytochrome c, class I  35.61 
 
 		 432 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  36.82 
 
 		 440 aa  244  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.16 
 
 		 440 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>