121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0317 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0317  putative GTP cyclohydrolase  100 
 
 
316 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3035  putative GTP cyclohydrolase  88.92 
 
 
316 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.072271  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5331  putative GTP cyclohydrolase  88.92 
 
 
316 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.631653  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4937  putative GTP cyclohydrolase  89.22 
 
 
306 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233652  normal  0.418134 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1099  putative GTP cyclohydrolase  70.86 
 
 
324 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0121166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3650  putative GTP cyclohydrolase  71.28 
 
 
296 aa  417  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3324  putative GTP cyclohydrolase  64.29 
 
 
324 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2420  putative GTP cyclohydrolase  63.76 
 
 
315 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2269  putative GTP cyclohydrolase  59.86 
 
 
301 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.660602  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2578  hypothetical protein  57.48 
 
 
301 aa  348  5e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176733  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29210  putative GTP cyclohydrolase  59.86 
 
 
298 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00695  putative GTP cyclohydrolase  54.04 
 
 
297 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24848  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0929  putative GTP cyclohydrolase  51.02 
 
 
299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0825  putative GTP cyclohydrolase  50.68 
 
 
299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600623  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1875  putative GTP cyclohydrolase  44.3 
 
 
315 aa  236  3e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0923  putative GTP cyclohydrolase  44.7 
 
 
306 aa  231  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134709  normal  0.123091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5658  putative GTP cyclohydrolase  50 
 
 
298 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4498  putative GTP cyclohydrolase  41.95 
 
 
308 aa  225  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5141  putative GTP cyclohydrolase  48.12 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.780092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5412  putative GTP cyclohydrolase  46.76 
 
 
301 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.320234  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2439  protein of unknown function DUF198  47.33 
 
 
314 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6341  putative GTP cyclohydrolase  46.64 
 
 
298 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0191  putative GTP cyclohydrolase  46.18 
 
 
304 aa  203  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73050  putative GTP cyclohydrolase  46.31 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.131305  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0301  putative GTP cyclohydrolase  40.27 
 
 
306 aa  199  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.624443  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4538  putative GTP cyclohydrolase  47.78 
 
 
296 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2628  putative GTP cyclohydrolase  46.28 
 
 
309 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.10548  normal  0.526872 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2312  GTP cyclohydrolase I  36.69 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1852  putative GTP cyclohydrolase  33.45 
 
 
359 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1937  putative GTP cyclohydrolase  38.08 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0501  putative GTP cyclohydrolase  33.45 
 
 
359 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291801  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1857  putative GTP cyclohydrolase  34.33 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0639  putative GTP cyclohydrolase  36.13 
 
 
359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473028  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2411  putative GTP cyclohydrolase  37.19 
 
 
367 aa  116  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.556277  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4297  putative GTP cyclohydrolase  33.44 
 
 
321 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1567  putative GTP cyclohydrolase  32.34 
 
 
327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0199115  normal  0.180744 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0484  putative GTP cyclohydrolase  27.96 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3074  putative GTP cyclohydrolase  27.3 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0544454  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0473  putative GTP cyclohydrolase  29.39 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2224  hypothetical protein  27.4 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3787  putative GTP cyclohydrolase  27.57 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3692  putative GTP cyclohydrolase  27.24 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1321  putative GTP cyclohydrolase  28.57 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0144328 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1052  protein of unknown function DUF198  30.49 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2134  GTP cyclohydrolase  26 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000813269  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0944  putative GTP cyclohydrolase  27.6 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0457  putative GTP cyclohydrolase  28.21 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2318  hypothetical protein  28.08 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2981  putative GTP cyclohydrolase  27.34 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1766  GTP cyclohydrolase  25.32 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716669 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0531  hypothetical protein  23.05 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1641  protein of unknown function DUF198  26.67 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1973  conserved hypothetical protein TIGR00294  26.67 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2039  hypothetical protein  26.62 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.868554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0830  hypothetical protein  24.32 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4045  putative GTP cyclohydrolase  25.45 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.96035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4100  hypothetical protein  26.88 
 
 
257 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0884  putative GTP cyclohydrolase  24.05 
 
 
259 aa  67  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.310056  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1986  putative GTP cyclohydrolase  27.82 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0906  putative GTP cyclohydrolase  24.05 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.131356  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3275  putative GTP cyclohydrolase  26.13 
 
 
276 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6780  putative GTP cyclohydrolase  25.84 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849591  hitchhiker  0.000971537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3230  putative GTP cyclohydrolase  29.07 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1031  GTP cyclohydrolase  26.18 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.489752  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1681  protein of unknown function DUF198  26.2 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0093  protein of unknown function DUF198  27.3 
 
 
264 aa  65.1  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0441  putative GTP cyclohydrolase  21.53 
 
 
256 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0615  putative GTP cyclohydrolase  23.49 
 
 
257 aa  63.9  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1703  hypothetical protein  26.06 
 
 
275 aa  63.5  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1773  putative GTP cyclohydrolase  25.25 
 
 
269 aa  63.5  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213945  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0237  hypothetical protein  26.88 
 
 
263 aa  63.2  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.703325  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1766  putative GTP cyclohydrolase  27.6 
 
 
260 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0878  GTP cyclohydrolase  23.79 
 
 
269 aa  62.4  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.76872  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2826  putative GTP cyclohydrolase  26.67 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0620  hypothetical protein  23.38 
 
 
261 aa  62.4  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2957  putative GTP cyclohydrolase  26.48 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133521  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1421  protein of unknown function DUF198  27.43 
 
 
275 aa  61.6  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0209  putative GTP cyclohydrolase  27.15 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0488  protein of unknown function DUF198  28.71 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1514  putative GTP cyclohydrolase  24.51 
 
 
277 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0366  putative GTP cyclohydrolase  24.51 
 
 
281 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0883  putative GTP cyclohydrolase  25.35 
 
 
270 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1707  putative GTP cyclohydrolase  24.67 
 
 
269 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2533  putative GTP cyclohydrolase  24.67 
 
 
269 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2391  putative GTP cyclohydrolase  24.67 
 
 
269 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.075557  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0331  putative GTP cyclohydrolase  25 
 
 
266 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0841  putative GTP cyclohydrolase  25 
 
 
266 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0489  GTP cyclohydrolase  27.54 
 
 
266 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427836  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2032  putative GTP cyclohydrolase  22.66 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.527904  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0781  protein of unknown function DUF198  23.4 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.783967  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2425  putative GTP cyclohydrolase  22.66 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0615  putative GTP cyclohydrolase  24.43 
 
 
277 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3947  putative GTP cyclohydrolase  24.37 
 
 
268 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1183  GTP cyclohydrolase  25.09 
 
 
319 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2220  putative GTP cyclohydrolase  22.66 
 
 
268 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0018  GTP cyclohydrolase  25 
 
 
311 aa  56.2  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2630  GTP cyclohydrolase  27.3 
 
 
300 aa  55.8  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0272371  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2334  GTP cyclohydrolase  24.69 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.163269  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4819  putative GTP cyclohydrolase  24.47 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765957  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1031  GTP cyclohydrolase  27.6 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59743  hitchhiker  0.00756508 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>