120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3324 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3324  putative GTP cyclohydrolase  100 
 
 		 324 aa  657    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2420  putative GTP cyclohydrolase  95.87 
 
 		 315 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1099  putative GTP cyclohydrolase  65.77 
 
 		 324 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0121166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3650  putative GTP cyclohydrolase  69.93 
 
 		 296 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0317  putative GTP cyclohydrolase  64.29 
 
 		 316 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3035  putative GTP cyclohydrolase  65.58 
 
 		 316 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.072271  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5331  putative GTP cyclohydrolase  65.58 
 
 		 316 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.631653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4937  putative GTP cyclohydrolase  66.44 
 
 		 306 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233652  normal  0.418134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29210  putative GTP cyclohydrolase  61.28 
 
 		 298 aa  355  5e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2269  putative GTP cyclohydrolase  61.22 
 
 		 301 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.660602  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2578  hypothetical protein  60.54 
 
 		 301 aa  348  6e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176733  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0929  putative GTP cyclohydrolase  53 
 
 		 299 aa  292  5e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0825  putative GTP cyclohydrolase  52.33 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00695  putative GTP cyclohydrolase  54.87 
 
 		 297 aa  271  8.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24848  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1875  putative GTP cyclohydrolase  46.46 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4498  putative GTP cyclohydrolase  43.92 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5658  putative GTP cyclohydrolase  49.33 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0923  putative GTP cyclohydrolase  43.29 
 
 		 306 aa  229  6e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134709  normal  0.123091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0301  putative GTP cyclohydrolase  43.05 
 
 		 306 aa  221  9e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.624443  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0191  putative GTP cyclohydrolase  47.31 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5141  putative GTP cyclohydrolase  46 
 
 		 295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.780092 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2439  protein of unknown function DUF198  46.4 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73050  putative GTP cyclohydrolase  49.5 
 
 		 298 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.131305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5412  putative GTP cyclohydrolase  45.33 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.320234  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6341  putative GTP cyclohydrolase  48.33 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4538  putative GTP cyclohydrolase  47.52 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2628  putative GTP cyclohydrolase  43.05 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.10548  normal  0.526872 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2312  GTP cyclohydrolase I  38.54 
 
 		 359 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1852  putative GTP cyclohydrolase  36.23 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0501  putative GTP cyclohydrolase  36.23 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1937  putative GTP cyclohydrolase  35.74 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2411  putative GTP cyclohydrolase  34.27 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.556277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0639  putative GTP cyclohydrolase  35.74 
 
 		 359 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473028  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4297  putative GTP cyclohydrolase  34.01 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1857  putative GTP cyclohydrolase  33.81 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1567  putative GTP cyclohydrolase  31.79 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0199115  normal  0.180744 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0484  putative GTP cyclohydrolase  26.79 
 
 		 258 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0473  putative GTP cyclohydrolase  28.18 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3074  putative GTP cyclohydrolase  26.01 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0544454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2224  hypothetical protein  25.71 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0944  putative GTP cyclohydrolase  29.18 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0830  hypothetical protein  26.17 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1766  GTP cyclohydrolase  28.26 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4045  putative GTP cyclohydrolase  25.81 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.96035  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2318  hypothetical protein  27.14 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3787  putative GTP cyclohydrolase  24 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1766  putative GTP cyclohydrolase  27.64 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1421  protein of unknown function DUF198  26.4 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1321  putative GTP cyclohydrolase  26.95 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0144328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2981  putative GTP cyclohydrolase  25.82 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5367  protein of unknown function DUF198  27.65 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1641  protein of unknown function DUF198  26.39 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1973  conserved hypothetical protein TIGR00294  26.39 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0883  putative GTP cyclohydrolase  25.18 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3692  putative GTP cyclohydrolase  23.67 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2826  putative GTP cyclohydrolase  27.12 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0457  putative GTP cyclohydrolase  25.75 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0531  hypothetical protein  24.38 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1703  hypothetical protein  26.89 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6780  putative GTP cyclohydrolase  25.85 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849591  hitchhiker  0.000971537 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1986  putative GTP cyclohydrolase  28.83 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3947  putative GTP cyclohydrolase  25.26 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3062  GTP cyclohydrolase  23.91 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000921807  unclonable  0.000000032257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2032  putative GTP cyclohydrolase  24.41 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.527904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2614  putative GTP cyclohydrolase  25.09 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.307548  normal  0.812477 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3275  putative GTP cyclohydrolase  25.62 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2425  putative GTP cyclohydrolase  24.41 
 
 		 268 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2134  GTP cyclohydrolase  25.09 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000813269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1052  protein of unknown function DUF198  27.8 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2220  putative GTP cyclohydrolase  24.29 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2039  hypothetical protein  25.62 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.868554  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1514  putative GTP cyclohydrolase  25.16 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0237  hypothetical protein  25.45 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.703325  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0366  putative GTP cyclohydrolase  25.16 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0906  putative GTP cyclohydrolase  25.44 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.131356  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4100  hypothetical protein  25.18 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0884  putative GTP cyclohydrolase  25.44 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.310056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0615  putative GTP cyclohydrolase  25.26 
 
 		 257 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1773  putative GTP cyclohydrolase  24.5 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213945  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0331  putative GTP cyclohydrolase  25 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0841  putative GTP cyclohydrolase  25 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0615  putative GTP cyclohydrolase  24.84 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1707  putative GTP cyclohydrolase  25 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2276  GTP cyclohydrolase  26.23 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.593749  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2533  putative GTP cyclohydrolase  25 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2391  putative GTP cyclohydrolase  25 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.075557  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1681  protein of unknown function DUF198  26.07 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4819  putative GTP cyclohydrolase  25.08 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2957  putative GTP cyclohydrolase  25.52 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133521  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3230  putative GTP cyclohydrolase  27.89 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2210  putative GTP cyclohydrolase  25.83 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0489  GTP cyclohydrolase  26.85 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2630  GTP cyclohydrolase  27.97 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0272371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2173  GTP cyclohydrolase  25.16 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0878  GTP cyclohydrolase  24.07 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.76872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0441  putative GTP cyclohydrolase  22.58 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3777  putative GTP cyclohydrolase  25.83 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730227  normal  0.0392269 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3251  putative GTP cyclohydrolase  25.83 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0781  protein of unknown function DUF198  22.73 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.783967  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4485  putative GTP cyclohydrolase  25.83 
 
 		 269 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>