114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2173 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2173  GTP cyclohydrolase  100 
 
 		 313 aa  643    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0083  GTP cyclohydrolase  80.32 
 
 		 317 aa  526  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0480  GTP cyclohydrolase  80.52 
 
 		 326 aa  518  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2334  GTP cyclohydrolase  76.92 
 
 		 328 aa  498  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.163269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0018  GTP cyclohydrolase  74.76 
 
 		 311 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1183  GTP cyclohydrolase  58.06 
 
 		 319 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0355  GTP cyclohydrolase  56.86 
 
 		 322 aa  350  1e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.498467  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0054  GTP cyclohydrolase  56.49 
 
 		 317 aa  345  7e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1583  GTP cyclohydrolase  46.91 
 
 		 309 aa  298  7e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1148  GTP cyclohydrolase  47.21 
 
 		 309 aa  298  8e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.713445  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2853  protein of unknown function DUF198  48.31 
 
 		 310 aa  297  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2260  GTP cyclohydrolase  45.45 
 
 		 340 aa  294  1e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0488  protein of unknown function DUF198  46.25 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1031  GTP cyclohydrolase  45.02 
 
 		 312 aa  280  3e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.489752  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1031  GTP cyclohydrolase  45.16 
 
 		 315 aa  279  5e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59743  hitchhiker  0.00756508 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2276  GTP cyclohydrolase  43.18 
 
 		 309 aa  279  5e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.593749  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0915  GTP cyclohydrolase  44.52 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.599141  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1646  GTP cyclohydrolase  44.52 
 
 		 315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.333029  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0781  protein of unknown function DUF198  38.54 
 
 		 290 aa  231  9e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.783967  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5367  protein of unknown function DUF198  40.38 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0579  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  34.53 
 
 		 480 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2039  hypothetical protein  28.33 
 
 		 267 aa  106  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.868554  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1773  putative GTP cyclohydrolase  28.38 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213945  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0878  GTP cyclohydrolase  28.72 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.76872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0457  putative GTP cyclohydrolase  25.85 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0944  putative GTP cyclohydrolase  27.55 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0473  putative GTP cyclohydrolase  30.16 
 
 		 266 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0237  hypothetical protein  28.09 
 
 		 263 aa  102  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.703325  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0531  hypothetical protein  26.64 
 
 		 259 aa  102  9e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2134  GTP cyclohydrolase  28.57 
 
 		 266 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000813269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3787  putative GTP cyclohydrolase  27.46 
 
 		 267 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1766  GTP cyclohydrolase  26.44 
 
 		 269 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3692  putative GTP cyclohydrolase  27.12 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3074  putative GTP cyclohydrolase  24.83 
 
 		 261 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0544454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0615  putative GTP cyclohydrolase  27.8 
 
 		 257 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0830  hypothetical protein  26.51 
 
 		 270 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1703  hypothetical protein  27.12 
 
 		 275 aa  97.4  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1321  putative GTP cyclohydrolase  27.3 
 
 		 259 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0144328 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0441  putative GTP cyclohydrolase  26.78 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0489  GTP cyclohydrolase  27.12 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3230  putative GTP cyclohydrolase  27.69 
 
 		 274 aa  95.9  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3947  putative GTP cyclohydrolase  27.46 
 
 		 268 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0484  putative GTP cyclohydrolase  23.47 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2318  hypothetical protein  26.78 
 
 		 268 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1052  protein of unknown function DUF198  27.03 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2614  putative GTP cyclohydrolase  27.09 
 
 		 267 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.307548  normal  0.812477 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4045  putative GTP cyclohydrolase  26.87 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.96035  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3062  GTP cyclohydrolase  25.94 
 
 		 270 aa  93.6  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000921807  unclonable  0.000000032257 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0589  putative GTP cyclohydrolase  27.57 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0603  putative GTP cyclohydrolase  27.57 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0209  putative GTP cyclohydrolase  28.62 
 
 		 264 aa  92.8  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3251  putative GTP cyclohydrolase  27.27 
 
 		 269 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4100  hypothetical protein  24.57 
 
 		 257 aa  92.4  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4485  putative GTP cyclohydrolase  27.61 
 
 		 269 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3880  putative GTP cyclohydrolase  27.61 
 
 		 269 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141532 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3275  putative GTP cyclohydrolase  25.85 
 
 		 276 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3647  putative GTP cyclohydrolase  27.61 
 
 		 269 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4819  putative GTP cyclohydrolase  27.8 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1421  protein of unknown function DUF198  27.12 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3777  putative GTP cyclohydrolase  26.94 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730227  normal  0.0392269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2210  putative GTP cyclohydrolase  26.78 
 
 		 269 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0883  putative GTP cyclohydrolase  27.27 
 
 		 270 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1986  putative GTP cyclohydrolase  25.94 
 
 		 259 aa  89.7  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2826  putative GTP cyclohydrolase  26.44 
 
 		 268 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2630  GTP cyclohydrolase  26.82 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0272371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6780  putative GTP cyclohydrolase  26.94 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849591  hitchhiker  0.000971537 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1269  protein of unknown function DUF198  27.05 
 
 		 256 aa  88.2  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000812404  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0093  protein of unknown function DUF198  28.72 
 
 		 264 aa  88.2  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2220  putative GTP cyclohydrolase  26.1 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0331  putative GTP cyclohydrolase  25.26 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0841  putative GTP cyclohydrolase  25.26 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0615  putative GTP cyclohydrolase  25.6 
 
 		 277 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1514  putative GTP cyclohydrolase  25.6 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1707  putative GTP cyclohydrolase  25.26 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2533  putative GTP cyclohydrolase  25.26 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2391  putative GTP cyclohydrolase  25.26 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.075557  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1766  putative GTP cyclohydrolase  26.1 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0366  putative GTP cyclohydrolase  25.6 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0212  putative GTP cyclohydrolase  25.08 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1641  protein of unknown function DUF198  26.85 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1973  conserved hypothetical protein TIGR00294  26.85 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2957  putative GTP cyclohydrolase  26.12 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133521  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0906  putative GTP cyclohydrolase  25 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.131356  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0884  putative GTP cyclohydrolase  25 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.310056  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0620  hypothetical protein  27.55 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2425  putative GTP cyclohydrolase  26.69 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2981  putative GTP cyclohydrolase  25.09 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2032  putative GTP cyclohydrolase  26.35 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.527904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1681  protein of unknown function DUF198  23.89 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2224  hypothetical protein  24.32 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0301  putative GTP cyclohydrolase  21.71 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.624443  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3035  putative GTP cyclohydrolase  26.54 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.072271  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5331  putative GTP cyclohydrolase  26.54 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.631653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3324  putative GTP cyclohydrolase  25.16 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0923  putative GTP cyclohydrolase  22.4 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134709  normal  0.123091 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73050  putative GTP cyclohydrolase  23.03 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.131305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4937  putative GTP cyclohydrolase  26.54 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233652  normal  0.418134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2420  putative GTP cyclohydrolase  24.52 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3650  putative GTP cyclohydrolase  23.47 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0317  putative GTP cyclohydrolase  24.84 
 
 		 316 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>