126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0841 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0331  putative GTP cyclohydrolase  100 
 
 
266 aa  546  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0841  putative GTP cyclohydrolase  100 
 
 
266 aa  546  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1514  putative GTP cyclohydrolase  100 
 
 
277 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1707  putative GTP cyclohydrolase  100 
 
 
269 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2533  putative GTP cyclohydrolase  100 
 
 
269 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2391  putative GTP cyclohydrolase  100 
 
 
269 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.075557  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0366  putative GTP cyclohydrolase  100 
 
 
281 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0615  putative GTP cyclohydrolase  98.12 
 
 
277 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2826  putative GTP cyclohydrolase  86.79 
 
 
268 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3251  putative GTP cyclohydrolase  86.09 
 
 
269 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3777  putative GTP cyclohydrolase  86.47 
 
 
269 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730227  normal  0.0392269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6780  putative GTP cyclohydrolase  86.69 
 
 
268 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849591  hitchhiker  0.000971537 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2210  putative GTP cyclohydrolase  86.09 
 
 
269 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4485  putative GTP cyclohydrolase  86.09 
 
 
269 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3880  putative GTP cyclohydrolase  86.09 
 
 
269 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.141532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4819  putative GTP cyclohydrolase  86.09 
 
 
269 aa  474  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765957  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3647  putative GTP cyclohydrolase  86.09 
 
 
269 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3947  putative GTP cyclohydrolase  85.55 
 
 
268 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0883  putative GTP cyclohydrolase  76.81 
 
 
270 aa  431  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2220  putative GTP cyclohydrolase  79.7 
 
 
268 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2425  putative GTP cyclohydrolase  80.23 
 
 
268 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2032  putative GTP cyclohydrolase  79.85 
 
 
268 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.527904  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2614  putative GTP cyclohydrolase  76.05 
 
 
267 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.307548  normal  0.812477 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0830  hypothetical protein  63.42 
 
 
270 aa  349  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2134  GTP cyclohydrolase  60.55 
 
 
266 aa  342  4e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000813269  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3062  GTP cyclohydrolase  58.78 
 
 
270 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000921807  unclonable  0.000000032257 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0878  GTP cyclohydrolase  60.23 
 
 
269 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.76872  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1773  putative GTP cyclohydrolase  60.08 
 
 
269 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213945  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0489  GTP cyclohydrolase  61.35 
 
 
266 aa  318  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427836  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2039  hypothetical protein  56.55 
 
 
267 aa  318  7e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.868554  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0237  hypothetical protein  58.3 
 
 
263 aa  318  7e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.703325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0944  putative GTP cyclohydrolase  58.75 
 
 
273 aa  317  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1986  putative GTP cyclohydrolase  57.59 
 
 
259 aa  311  4.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1052  protein of unknown function DUF198  59.18 
 
 
268 aa  310  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2630  GTP cyclohydrolase  58.04 
 
 
300 aa  309  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0272371  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1973  conserved hypothetical protein TIGR00294  55.08 
 
 
264 aa  297  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1641  protein of unknown function DUF198  55.08 
 
 
264 aa  297  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2318  hypothetical protein  56.76 
 
 
268 aa  293  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1703  hypothetical protein  54.21 
 
 
275 aa  289  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1421  protein of unknown function DUF198  55.68 
 
 
275 aa  282  4.0000000000000003e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1766  GTP cyclohydrolase  49.24 
 
 
269 aa  271  7e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3074  putative GTP cyclohydrolase  50.97 
 
 
261 aa  269  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0544454  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0484  putative GTP cyclohydrolase  50.97 
 
 
258 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1681  protein of unknown function DUF198  51.36 
 
 
263 aa  260  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4045  putative GTP cyclohydrolase  48.84 
 
 
285 aa  254  8e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.96035  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3692  putative GTP cyclohydrolase  49.42 
 
 
267 aa  254  9e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3787  putative GTP cyclohydrolase  50.19 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4100  hypothetical protein  48.06 
 
 
257 aa  251  8.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2224  hypothetical protein  48.22 
 
 
260 aa  246  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0093  protein of unknown function DUF198  48.85 
 
 
264 aa  244  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3275  putative GTP cyclohydrolase  46.18 
 
 
276 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0457  putative GTP cyclohydrolase  47.89 
 
 
266 aa  241  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0531  hypothetical protein  44.27 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0209  putative GTP cyclohydrolase  47.24 
 
 
264 aa  231  9e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2981  putative GTP cyclohydrolase  45.85 
 
 
269 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0441  putative GTP cyclohydrolase  44.31 
 
 
256 aa  218  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1766  putative GTP cyclohydrolase  45.67 
 
 
260 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0906  putative GTP cyclohydrolase  43.7 
 
 
259 aa  214  8e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.131356  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0884  putative GTP cyclohydrolase  43.7 
 
 
259 aa  214  9e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.310056  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1321  putative GTP cyclohydrolase  44.02 
 
 
259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0144328 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0615  putative GTP cyclohydrolase  42.52 
 
 
257 aa  211  9e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0620  hypothetical protein  45 
 
 
261 aa  209  3e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3230  putative GTP cyclohydrolase  44.88 
 
 
274 aa  203  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0473  putative GTP cyclohydrolase  44.09 
 
 
266 aa  201  9e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2957  putative GTP cyclohydrolase  42.19 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133521  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1269  protein of unknown function DUF198  39.61 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000812404  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0589  putative GTP cyclohydrolase  35.71 
 
 
292 aa  155  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0603  putative GTP cyclohydrolase  35.71 
 
 
292 aa  155  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0212  putative GTP cyclohydrolase  35.47 
 
 
292 aa  155  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1567  putative GTP cyclohydrolase  27.8 
 
 
327 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0199115  normal  0.180744 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2312  GTP cyclohydrolase I  28.78 
 
 
359 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0781  protein of unknown function DUF198  29.75 
 
 
290 aa  96.7  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.783967  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0579  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  28.82 
 
 
480 aa  96.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0018  GTP cyclohydrolase  29 
 
 
311 aa  94  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1183  GTP cyclohydrolase  26.58 
 
 
319 aa  92.8  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1583  GTP cyclohydrolase  27.49 
 
 
309 aa  91.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0083  GTP cyclohydrolase  29 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5367  protein of unknown function DUF198  27.99 
 
 
333 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1857  putative GTP cyclohydrolase  28.09 
 
 
362 aa  89.4  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229026 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2334  GTP cyclohydrolase  25.67 
 
 
328 aa  87.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.163269  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4297  putative GTP cyclohydrolase  28.04 
 
 
321 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0639  putative GTP cyclohydrolase  27.68 
 
 
359 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473028  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2411  putative GTP cyclohydrolase  26.94 
 
 
367 aa  86.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.556277  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2173  GTP cyclohydrolase  25.26 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1937  putative GTP cyclohydrolase  27.74 
 
 
367 aa  84  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1852  putative GTP cyclohydrolase  26.37 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0501  putative GTP cyclohydrolase  26.37 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291801  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2260  GTP cyclohydrolase  26.21 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0556  hypothetical protein  25.69 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0480  GTP cyclohydrolase  26.69 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0355  GTP cyclohydrolase  28.57 
 
 
322 aa  82.4  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.498467  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2276  GTP cyclohydrolase  25.94 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.593749  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0054  GTP cyclohydrolase  30.26 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1875  putative GTP cyclohydrolase  23.49 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0301  putative GTP cyclohydrolase  24.83 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.624443  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0923  putative GTP cyclohydrolase  24.67 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134709  normal  0.123091 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2853  protein of unknown function DUF198  25.26 
 
 
310 aa  78.6  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4498  putative GTP cyclohydrolase  22.37 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1148  GTP cyclohydrolase  27.7 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.713445  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1031  GTP cyclohydrolase  27.27 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59743  hitchhiker  0.00756508 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>