127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2224 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2224  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  545  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4100  hypothetical protein  60.08 
 
 		 257 aa  323  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2981  putative GTP cyclohydrolase  55.73 
 
 		 269 aa  298  7e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0484  putative GTP cyclohydrolase  54.94 
 
 		 258 aa  298  8e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4045  putative GTP cyclohydrolase  53.36 
 
 		 285 aa  295  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.96035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3275  putative GTP cyclohydrolase  52.14 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3787  putative GTP cyclohydrolase  52.53 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3692  putative GTP cyclohydrolase  52.14 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1766  GTP cyclohydrolase  54.09 
 
 		 269 aa  292  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0457  putative GTP cyclohydrolase  52.53 
 
 		 266 aa  291  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3074  putative GTP cyclohydrolase  54.15 
 
 		 261 aa  291  7e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0544454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2039  hypothetical protein  52.96 
 
 		 267 aa  289  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.868554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0830  hypothetical protein  54.55 
 
 		 270 aa  287  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0237  hypothetical protein  53.1 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.703325  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2134  GTP cyclohydrolase  54.15 
 
 		 266 aa  287  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000813269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0531  hypothetical protein  51.76 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0878  GTP cyclohydrolase  52.57 
 
 		 269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.76872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3062  GTP cyclohydrolase  50.78 
 
 		 270 aa  277  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000921807  unclonable  0.000000032257 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1773  putative GTP cyclohydrolase  51.79 
 
 		 269 aa  277  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213945  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0944  putative GTP cyclohydrolase  49.8 
 
 		 273 aa  275  6e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0620  hypothetical protein  50.39 
 
 		 261 aa  271  9e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0093  protein of unknown function DUF198  50.2 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1973  conserved hypothetical protein TIGR00294  50.2 
 
 		 264 aa  268  5e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1641  protein of unknown function DUF198  50.2 
 
 		 264 aa  268  5e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1986  putative GTP cyclohydrolase  49.8 
 
 		 259 aa  263  3e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2318  hypothetical protein  49.41 
 
 		 268 aa  257  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0441  putative GTP cyclohydrolase  47.43 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0906  putative GTP cyclohydrolase  46.88 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.131356  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3947  putative GTP cyclohydrolase  49.8 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6780  putative GTP cyclohydrolase  48.22 
 
 		 268 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849591  hitchhiker  0.000971537 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0884  putative GTP cyclohydrolase  46.48 
 
 		 259 aa  251  7e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.310056  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0883  putative GTP cyclohydrolase  48.22 
 
 		 270 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1766  putative GTP cyclohydrolase  47.04 
 
 		 260 aa  250  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0473  putative GTP cyclohydrolase  47.83 
 
 		 266 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2957  putative GTP cyclohydrolase  47.43 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133521  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2826  putative GTP cyclohydrolase  48.62 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1321  putative GTP cyclohydrolase  47.43 
 
 		 259 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0144328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4819  putative GTP cyclohydrolase  48.62 
 
 		 269 aa  248  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765957  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0331  putative GTP cyclohydrolase  48.22 
 
 		 266 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0841  putative GTP cyclohydrolase  48.22 
 
 		 266 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0615  putative GTP cyclohydrolase  48.22 
 
 		 277 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1514  putative GTP cyclohydrolase  48.22 
 
 		 277 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1707  putative GTP cyclohydrolase  48.22 
 
 		 269 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2533  putative GTP cyclohydrolase  48.22 
 
 		 269 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2391  putative GTP cyclohydrolase  48.22 
 
 		 269 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.075557  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0366  putative GTP cyclohydrolase  48.22 
 
 		 281 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0489  GTP cyclohydrolase  47.04 
 
 		 266 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0209  putative GTP cyclohydrolase  45.45 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0615  putative GTP cyclohydrolase  45.38 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2210  putative GTP cyclohydrolase  47.43 
 
 		 269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3777  putative GTP cyclohydrolase  47.43 
 
 		 269 aa  241  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730227  normal  0.0392269 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3251  putative GTP cyclohydrolase  47.43 
 
 		 269 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4485  putative GTP cyclohydrolase  47.43 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3880  putative GTP cyclohydrolase  47.43 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3647  putative GTP cyclohydrolase  47.43 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2614  putative GTP cyclohydrolase  46.25 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.307548  normal  0.812477 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1052  protein of unknown function DUF198  43.87 
 
 		 268 aa  238  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2220  putative GTP cyclohydrolase  46.25 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2032  putative GTP cyclohydrolase  46.25 
 
 		 268 aa  232  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.527904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2425  putative GTP cyclohydrolase  46.25 
 
 		 268 aa  232  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1703  hypothetical protein  45.98 
 
 		 275 aa  228  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2630  GTP cyclohydrolase  42.76 
 
 		 300 aa  218  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0272371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3230  putative GTP cyclohydrolase  43.87 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1421  protein of unknown function DUF198  45.25 
 
 		 275 aa  214  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1681  protein of unknown function DUF198  44.09 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1269  protein of unknown function DUF198  37.4 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000812404  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0589  putative GTP cyclohydrolase  35.23 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0603  putative GTP cyclohydrolase  35.23 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0212  putative GTP cyclohydrolase  34.6 
 
 		 292 aa  131  9e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1852  putative GTP cyclohydrolase  31.89 
 
 		 359 aa  121  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0501  putative GTP cyclohydrolase  31.89 
 
 		 359 aa  121  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0639  putative GTP cyclohydrolase  31.89 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473028  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2411  putative GTP cyclohydrolase  31.18 
 
 		 367 aa  111  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.556277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1937  putative GTP cyclohydrolase  29.8 
 
 		 367 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4297  putative GTP cyclohydrolase  29.13 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2312  GTP cyclohydrolase I  27.24 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1857  putative GTP cyclohydrolase  29.84 
 
 		 362 aa  99  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229026 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0781  protein of unknown function DUF198  30.6 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.783967  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0579  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  26.92 
 
 		 480 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1567  putative GTP cyclohydrolase  28.19 
 
 		 327 aa  97.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0199115  normal  0.180744 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0556  hypothetical protein  26.27 
 
 		 263 aa  95.5  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1183  GTP cyclohydrolase  27.63 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5367  protein of unknown function DUF198  27.3 
 
 		 333 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2269  putative GTP cyclohydrolase  29.29 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.660602  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0355  GTP cyclohydrolase  26.1 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.498467  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1148  GTP cyclohydrolase  28 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.713445  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0317  putative GTP cyclohydrolase  27.4 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0923  putative GTP cyclohydrolase  26.06 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134709  normal  0.123091 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1031  GTP cyclohydrolase  28.81 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59743  hitchhiker  0.00756508 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0915  GTP cyclohydrolase  27.52 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.599141  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0083  GTP cyclohydrolase  25.61 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2578  hypothetical protein  26.95 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176733  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1031  GTP cyclohydrolase  27.24 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.489752  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3324  putative GTP cyclohydrolase  25.71 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0054  GTP cyclohydrolase  25.94 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1099  putative GTP cyclohydrolase  27.14 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0121166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29210  putative GTP cyclohydrolase  25.27 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2420  putative GTP cyclohydrolase  25.36 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0191  putative GTP cyclohydrolase  25.99 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00695  putative GTP cyclohydrolase  26.6 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>