123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2411 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2411  putative GTP cyclohydrolase  100 
 
 		 367 aa  759    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.556277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0639  putative GTP cyclohydrolase  75.75 
 
 		 359 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473028  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1852  putative GTP cyclohydrolase  75.48 
 
 		 359 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1937  putative GTP cyclohydrolase  72.83 
 
 		 367 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0501  putative GTP cyclohydrolase  75.48 
 
 		 359 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1857  putative GTP cyclohydrolase  68.39 
 
 		 362 aa  512  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229026 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4297  putative GTP cyclohydrolase  72.58 
 
 		 321 aa  472  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1567  putative GTP cyclohydrolase  53.85 
 
 		 327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0199115  normal  0.180744 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2312  GTP cyclohydrolase I  56.46 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4498  putative GTP cyclohydrolase  33.33 
 
 		 308 aa  149  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00695  putative GTP cyclohydrolase  34.41 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24848  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0301  putative GTP cyclohydrolase  32.89 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.624443  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1875  putative GTP cyclohydrolase  33.33 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0923  putative GTP cyclohydrolase  30.49 
 
 		 306 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134709  normal  0.123091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3035  putative GTP cyclohydrolase  34.6 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.072271  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5331  putative GTP cyclohydrolase  34.6 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.631653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0929  putative GTP cyclohydrolase  34.34 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1099  putative GTP cyclohydrolase  34.64 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0121166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3324  putative GTP cyclohydrolase  34.27 
 
 		 324 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4937  putative GTP cyclohydrolase  38.17 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233652  normal  0.418134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6341  putative GTP cyclohydrolase  35.02 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0825  putative GTP cyclohydrolase  33.67 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600623  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5141  putative GTP cyclohydrolase  32.6 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.780092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2269  putative GTP cyclohydrolase  33.79 
 
 		 301 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.660602  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29210  putative GTP cyclohydrolase  37.24 
 
 		 298 aa  117  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3650  putative GTP cyclohydrolase  34.48 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0317  putative GTP cyclohydrolase  37.19 
 
 		 316 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2420  putative GTP cyclohydrolase  34.27 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4538  putative GTP cyclohydrolase  33.09 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0191  putative GTP cyclohydrolase  33.11 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2578  hypothetical protein  37.24 
 
 		 301 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176733  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5658  putative GTP cyclohydrolase  30.94 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2224  hypothetical protein  31.18 
 
 		 260 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5412  putative GTP cyclohydrolase  31.87 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.320234  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2957  putative GTP cyclohydrolase  27.82 
 
 		 256 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133521  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0237  hypothetical protein  30.83 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.703325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73050  putative GTP cyclohydrolase  32.44 
 
 		 298 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.131305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1321  putative GTP cyclohydrolase  28.2 
 
 		 259 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0144328 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0473  putative GTP cyclohydrolase  28.2 
 
 		 266 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0906  putative GTP cyclohydrolase  29.02 
 
 		 259 aa  107  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.131356  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0884  putative GTP cyclohydrolase  29.02 
 
 		 259 aa  106  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.310056  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0531  hypothetical protein  25.78 
 
 		 259 aa  106  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0944  putative GTP cyclohydrolase  29.44 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1641  protein of unknown function DUF198  30.16 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1973  conserved hypothetical protein TIGR00294  30.16 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1986  putative GTP cyclohydrolase  27.91 
 
 		 259 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0209  putative GTP cyclohydrolase  28.06 
 
 		 264 aa  100  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1766  GTP cyclohydrolase  27.84 
 
 		 269 aa  99.4  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716669 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2439  protein of unknown function DUF198  27.52 
 
 		 314 aa  99.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4100  hypothetical protein  29.18 
 
 		 257 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2614  putative GTP cyclohydrolase  29.26 
 
 		 267 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.307548  normal  0.812477 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3777  putative GTP cyclohydrolase  28.78 
 
 		 269 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730227  normal  0.0392269 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2039  hypothetical protein  26.48 
 
 		 267 aa  96.3  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.868554  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2210  putative GTP cyclohydrolase  29.93 
 
 		 269 aa  96.3  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3251  putative GTP cyclohydrolase  28.78 
 
 		 269 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0883  putative GTP cyclohydrolase  30.15 
 
 		 270 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3230  putative GTP cyclohydrolase  26.32 
 
 		 274 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4819  putative GTP cyclohydrolase  30.29 
 
 		 269 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2826  putative GTP cyclohydrolase  28.94 
 
 		 268 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6780  putative GTP cyclohydrolase  28.57 
 
 		 268 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849591  hitchhiker  0.000971537 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0615  putative GTP cyclohydrolase  24.71 
 
 		 257 aa  94.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1773  putative GTP cyclohydrolase  27.57 
 
 		 269 aa  94.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213945  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3062  GTP cyclohydrolase  26.94 
 
 		 270 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000921807  unclonable  0.000000032257 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4485  putative GTP cyclohydrolase  29.56 
 
 		 269 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3880  putative GTP cyclohydrolase  29.56 
 
 		 269 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3647  putative GTP cyclohydrolase  29.56 
 
 		 269 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2318  hypothetical protein  27.84 
 
 		 268 aa  92  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0830  hypothetical protein  26.88 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3947  putative GTP cyclohydrolase  27.78 
 
 		 268 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1052  protein of unknown function DUF198  30.63 
 
 		 268 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2981  putative GTP cyclohydrolase  27.34 
 
 		 269 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2628  putative GTP cyclohydrolase  28.62 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.10548  normal  0.526872 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2134  GTP cyclohydrolase  25.83 
 
 		 266 aa  90.9  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000813269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0441  putative GTP cyclohydrolase  28.52 
 
 		 256 aa  89.7  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0489  GTP cyclohydrolase  26.84 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1766  putative GTP cyclohydrolase  27.6 
 
 		 260 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0878  GTP cyclohydrolase  27.78 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.76872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0093  protein of unknown function DUF198  28.19 
 
 		 264 aa  87.8  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0457  putative GTP cyclohydrolase  28.68 
 
 		 266 aa  87  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0615  putative GTP cyclohydrolase  27.04 
 
 		 277 aa  86.7  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0331  putative GTP cyclohydrolase  26.94 
 
 		 266 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0841  putative GTP cyclohydrolase  26.94 
 
 		 266 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1707  putative GTP cyclohydrolase  26.94 
 
 		 269 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2533  putative GTP cyclohydrolase  26.94 
 
 		 269 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2391  putative GTP cyclohydrolase  26.94 
 
 		 269 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.075557  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1514  putative GTP cyclohydrolase  26.94 
 
 		 277 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0366  putative GTP cyclohydrolase  26.94 
 
 		 281 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3275  putative GTP cyclohydrolase  27.24 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3074  putative GTP cyclohydrolase  26.84 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0544454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0620  hypothetical protein  28.52 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2630  GTP cyclohydrolase  26.98 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0272371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2425  putative GTP cyclohydrolase  27.11 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2032  putative GTP cyclohydrolase  27.11 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.527904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4045  putative GTP cyclohydrolase  25.4 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.96035  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3787  putative GTP cyclohydrolase  25.91 
 
 		 267 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2220  putative GTP cyclohydrolase  27.21 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3692  putative GTP cyclohydrolase  25.55 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0484  putative GTP cyclohydrolase  26.35 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0212  putative GTP cyclohydrolase  26.79 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0589  putative GTP cyclohydrolase  24.19 
 
 		 292 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>