119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0301 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0301  putative GTP cyclohydrolase  100 
 
 		 306 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.624443  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0923  putative GTP cyclohydrolase  45.15 
 
 		 306 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134709  normal  0.123091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4498  putative GTP cyclohydrolase  42.19 
 
 		 308 aa  258  7e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1875  putative GTP cyclohydrolase  42.14 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5141  putative GTP cyclohydrolase  44.22 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.780092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5658  putative GTP cyclohydrolase  45.08 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0191  putative GTP cyclohydrolase  44.09 
 
 		 304 aa  228  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5412  putative GTP cyclohydrolase  44.9 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.320234  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3324  putative GTP cyclohydrolase  43.05 
 
 		 324 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2420  putative GTP cyclohydrolase  42.72 
 
 		 315 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73050  putative GTP cyclohydrolase  45.58 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.131305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6341  putative GTP cyclohydrolase  45.92 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4538  putative GTP cyclohydrolase  43.99 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29210  putative GTP cyclohydrolase  41.95 
 
 		 298 aa  215  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2439  protein of unknown function DUF198  43.49 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1099  putative GTP cyclohydrolase  41.06 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0121166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3650  putative GTP cyclohydrolase  41.31 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0929  putative GTP cyclohydrolase  39.6 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0825  putative GTP cyclohydrolase  39.6 
 
 		 299 aa  202  4e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00695  putative GTP cyclohydrolase  41.33 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24848  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3035  putative GTP cyclohydrolase  40.13 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.072271  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5331  putative GTP cyclohydrolase  40.13 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.631653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4937  putative GTP cyclohydrolase  40.45 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233652  normal  0.418134 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0317  putative GTP cyclohydrolase  40.27 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2578  hypothetical protein  39.6 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2269  putative GTP cyclohydrolase  39.6 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.660602  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2628  putative GTP cyclohydrolase  39.86 
 
 		 309 aa  192  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.10548  normal  0.526872 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2411  putative GTP cyclohydrolase  32.89 
 
 		 367 aa  135  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.556277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4297  putative GTP cyclohydrolase  33 
 
 		 321 aa  129  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1937  putative GTP cyclohydrolase  32 
 
 		 367 aa  126  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1852  putative GTP cyclohydrolase  30.41 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0501  putative GTP cyclohydrolase  30.41 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0639  putative GTP cyclohydrolase  30.74 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473028  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1857  putative GTP cyclohydrolase  30.77 
 
 		 362 aa  122  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229026 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2312  GTP cyclohydrolase I  31.54 
 
 		 359 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1567  putative GTP cyclohydrolase  29.63 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0199115  normal  0.180744 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0883  putative GTP cyclohydrolase  24.59 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0531  hypothetical protein  28.67 
 
 		 259 aa  88.2  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0473  putative GTP cyclohydrolase  27.55 
 
 		 266 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6780  putative GTP cyclohydrolase  26.16 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849591  hitchhiker  0.000971537 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0615  putative GTP cyclohydrolase  24.58 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2826  putative GTP cyclohydrolase  25.5 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3251  putative GTP cyclohydrolase  25.17 
 
 		 269 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0331  putative GTP cyclohydrolase  24.83 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0841  putative GTP cyclohydrolase  24.83 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1514  putative GTP cyclohydrolase  25.08 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1707  putative GTP cyclohydrolase  24.83 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2533  putative GTP cyclohydrolase  24.83 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2391  putative GTP cyclohydrolase  24.83 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.075557  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0366  putative GTP cyclohydrolase  25.08 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3777  putative GTP cyclohydrolase  24.83 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730227  normal  0.0392269 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0830  hypothetical protein  24.41 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1321  putative GTP cyclohydrolase  26.43 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0144328 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2318  hypothetical protein  23.76 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0484  putative GTP cyclohydrolase  26.37 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0457  putative GTP cyclohydrolase  26.69 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2957  putative GTP cyclohydrolase  27.18 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133521  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4485  putative GTP cyclohydrolase  24.5 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3880  putative GTP cyclohydrolase  24.5 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3647  putative GTP cyclohydrolase  24.5 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4045  putative GTP cyclohydrolase  26.19 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.96035  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2210  putative GTP cyclohydrolase  24.5 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2614  putative GTP cyclohydrolase  22.37 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.307548  normal  0.812477 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3947  putative GTP cyclohydrolase  22.82 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2981  putative GTP cyclohydrolase  25.82 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0906  putative GTP cyclohydrolase  24.05 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.131356  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3074  putative GTP cyclohydrolase  25.26 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0544454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0944  putative GTP cyclohydrolase  23.63 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1766  GTP cyclohydrolase  26.18 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716669 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0884  putative GTP cyclohydrolase  24.05 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.310056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4100  hypothetical protein  24.82 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0615  putative GTP cyclohydrolase  25 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2224  hypothetical protein  24.91 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0237  hypothetical protein  24.23 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.703325  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2276  GTP cyclohydrolase  24.75 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.593749  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3275  putative GTP cyclohydrolase  26.26 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0488  protein of unknown function DUF198  23.55 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1052  protein of unknown function DUF198  26.56 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3787  putative GTP cyclohydrolase  27.76 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3692  putative GTP cyclohydrolase  28.11 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1641  protein of unknown function DUF198  23.13 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1973  conserved hypothetical protein TIGR00294  23.13 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2220  putative GTP cyclohydrolase  23.76 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2425  putative GTP cyclohydrolase  23.76 
 
 		 268 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2032  putative GTP cyclohydrolase  23.76 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.527904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3062  GTP cyclohydrolase  22.6 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000921807  unclonable  0.000000032257 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4819  putative GTP cyclohydrolase  22.85 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1766  putative GTP cyclohydrolase  25.69 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2853  protein of unknown function DUF198  23.55 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1703  hypothetical protein  23.75 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5367  protein of unknown function DUF198  25.26 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0781  protein of unknown function DUF198  23.84 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.783967  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2173  GTP cyclohydrolase  21.71 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1773  putative GTP cyclohydrolase  23.75 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213945  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2134  GTP cyclohydrolase  23.43 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000813269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2039  hypothetical protein  22.34 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.868554  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2334  GTP cyclohydrolase  21.12 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.163269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1421  protein of unknown function DUF198  23.92 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1183  GTP cyclohydrolase  21.17 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0620  hypothetical protein  25.53 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>