127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0473 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0473  putative GTP cyclohydrolase  100 
 
 		 266 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1321  putative GTP cyclohydrolase  87.5 
 
 		 259 aa  471  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0144328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2957  putative GTP cyclohydrolase  79.13 
 
 		 256 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133521  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1766  putative GTP cyclohydrolase  70.43 
 
 		 260 aa  384  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0209  putative GTP cyclohydrolase  58.11 
 
 		 264 aa  317  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3230  putative GTP cyclohydrolase  62.99 
 
 		 274 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2981  putative GTP cyclohydrolase  49.62 
 
 		 269 aa  272  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4045  putative GTP cyclohydrolase  47.78 
 
 		 285 aa  267  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.96035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4100  hypothetical protein  50.39 
 
 		 257 aa  265  8e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2318  hypothetical protein  50.78 
 
 		 268 aa  261  6e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3787  putative GTP cyclohydrolase  48.24 
 
 		 267 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0484  putative GTP cyclohydrolase  49.61 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3692  putative GTP cyclohydrolase  47.06 
 
 		 267 aa  255  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2039  hypothetical protein  48.43 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.868554  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1766  GTP cyclohydrolase  47.84 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3074  putative GTP cyclohydrolase  47.24 
 
 		 261 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0544454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2224  hypothetical protein  47.83 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0531  hypothetical protein  47.66 
 
 		 259 aa  250  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3275  putative GTP cyclohydrolase  46.64 
 
 		 276 aa  249  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0457  putative GTP cyclohydrolase  47.83 
 
 		 266 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0830  hypothetical protein  47.64 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1986  putative GTP cyclohydrolase  47.64 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2134  GTP cyclohydrolase  46.06 
 
 		 266 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000813269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0615  putative GTP cyclohydrolase  44.53 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0944  putative GTP cyclohydrolase  45.95 
 
 		 273 aa  235  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0620  hypothetical protein  44.84 
 
 		 261 aa  234  8e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0093  protein of unknown function DUF198  47.31 
 
 		 264 aa  232  6e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0906  putative GTP cyclohydrolase  46.85 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.131356  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0441  putative GTP cyclohydrolase  44.36 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0884  putative GTP cyclohydrolase  46.46 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.310056  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3062  GTP cyclohydrolase  43.25 
 
 		 270 aa  224  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000921807  unclonable  0.000000032257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0237  hypothetical protein  43.53 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.703325  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0878  GTP cyclohydrolase  43.08 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.76872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1773  putative GTP cyclohydrolase  45.06 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213945  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1973  conserved hypothetical protein TIGR00294  44.27 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1641  protein of unknown function DUF198  44.27 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2826  putative GTP cyclohydrolase  46.06 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6780  putative GTP cyclohydrolase  45.67 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849591  hitchhiker  0.000971537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1052  protein of unknown function DUF198  43.46 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3947  putative GTP cyclohydrolase  44.66 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3251  putative GTP cyclohydrolase  44.49 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3777  putative GTP cyclohydrolase  44.49 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730227  normal  0.0392269 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1707  putative GTP cyclohydrolase  44.09 
 
 		 269 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2533  putative GTP cyclohydrolase  44.09 
 
 		 269 aa  201  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2391  putative GTP cyclohydrolase  44.09 
 
 		 269 aa  201  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.075557  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0366  putative GTP cyclohydrolase  44.09 
 
 		 281 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1514  putative GTP cyclohydrolase  44.09 
 
 		 277 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0331  putative GTP cyclohydrolase  44.09 
 
 		 266 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0841  putative GTP cyclohydrolase  44.09 
 
 		 266 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0883  putative GTP cyclohydrolase  44.49 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0615  putative GTP cyclohydrolase  43.7 
 
 		 277 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2210  putative GTP cyclohydrolase  43.7 
 
 		 269 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2614  putative GTP cyclohydrolase  43.87 
 
 		 267 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.307548  normal  0.812477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4485  putative GTP cyclohydrolase  43.7 
 
 		 269 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3880  putative GTP cyclohydrolase  43.7 
 
 		 269 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3647  putative GTP cyclohydrolase  43.7 
 
 		 269 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1681  protein of unknown function DUF198  44.14 
 
 		 263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4819  putative GTP cyclohydrolase  43.31 
 
 		 269 aa  195  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2032  putative GTP cyclohydrolase  43.31 
 
 		 268 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.527904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0489  GTP cyclohydrolase  42.69 
 
 		 266 aa  191  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2425  putative GTP cyclohydrolase  43.31 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2220  putative GTP cyclohydrolase  43.31 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1703  hypothetical protein  39.23 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2630  GTP cyclohydrolase  40.28 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0272371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1421  protein of unknown function DUF198  38.46 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1269  protein of unknown function DUF198  40 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000812404  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0589  putative GTP cyclohydrolase  32.33 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0603  putative GTP cyclohydrolase  32.33 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0212  putative GTP cyclohydrolase  30.83 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4498  putative GTP cyclohydrolase  28.52 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1852  putative GTP cyclohydrolase  30.45 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0501  putative GTP cyclohydrolase  30.45 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0923  putative GTP cyclohydrolase  29.67 
 
 		 306 aa  116  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134709  normal  0.123091 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0639  putative GTP cyclohydrolase  31.06 
 
 		 359 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473028  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4297  putative GTP cyclohydrolase  30.04 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2411  putative GTP cyclohydrolase  28.2 
 
 		 367 aa  106  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.556277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1937  putative GTP cyclohydrolase  28.46 
 
 		 367 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0781  protein of unknown function DUF198  32.73 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.783967  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0579  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  29.58 
 
 		 480 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1183  GTP cyclohydrolase  29.59 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2173  GTP cyclohydrolase  30.16 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0556  hypothetical protein  26.64 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1857  putative GTP cyclohydrolase  28.46 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229026 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2334  GTP cyclohydrolase  28.05 
 
 		 328 aa  89.7  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.163269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1875  putative GTP cyclohydrolase  26.69 
 
 		 315 aa  88.6  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00695  putative GTP cyclohydrolase  28.11 
 
 		 297 aa  88.6  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24848  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3035  putative GTP cyclohydrolase  31.43 
 
 		 316 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.072271  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5331  putative GTP cyclohydrolase  31.43 
 
 		 316 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.631653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0301  putative GTP cyclohydrolase  27.55 
 
 		 306 aa  86.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.624443  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2260  GTP cyclohydrolase  29.21 
 
 		 340 aa  85.9  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2312  GTP cyclohydrolase I  27.04 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4937  putative GTP cyclohydrolase  31.07 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233652  normal  0.418134 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1567  putative GTP cyclohydrolase  26.74 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0199115  normal  0.180744 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0083  GTP cyclohydrolase  27.81 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5141  putative GTP cyclohydrolase  26.71 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.780092 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1148  GTP cyclohydrolase  29.14 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.713445  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0915  GTP cyclohydrolase  28.95 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.599141  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0929  putative GTP cyclohydrolase  28.72 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0825  putative GTP cyclohydrolase  28.37 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600623  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0317  putative GTP cyclohydrolase  29.39 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>