129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2220 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2220  putative GTP cyclohydrolase  100 
 
 		 268 aa  558  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2425  putative GTP cyclohydrolase  97.36 
 
 		 268 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2032  putative GTP cyclohydrolase  96.6 
 
 		 268 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.527904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0883  putative GTP cyclohydrolase  84.15 
 
 		 270 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2614  putative GTP cyclohydrolase  81.89 
 
 		 267 aa  461  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.307548  normal  0.812477 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3777  putative GTP cyclohydrolase  79.55 
 
 		 269 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730227  normal  0.0392269 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3251  putative GTP cyclohydrolase  79.18 
 
 		 269 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2210  putative GTP cyclohydrolase  79.18 
 
 		 269 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0615  putative GTP cyclohydrolase  80.52 
 
 		 277 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4485  putative GTP cyclohydrolase  79.18 
 
 		 269 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3880  putative GTP cyclohydrolase  79.18 
 
 		 269 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4819  putative GTP cyclohydrolase  79.18 
 
 		 269 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3647  putative GTP cyclohydrolase  79.18 
 
 		 269 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6780  putative GTP cyclohydrolase  78.73 
 
 		 268 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849591  hitchhiker  0.000971537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2826  putative GTP cyclohydrolase  78.95 
 
 		 268 aa  441  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1514  putative GTP cyclohydrolase  79.55 
 
 		 277 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1707  putative GTP cyclohydrolase  79.55 
 
 		 269 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2533  putative GTP cyclohydrolase  79.55 
 
 		 269 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2391  putative GTP cyclohydrolase  79.55 
 
 		 269 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.075557  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0366  putative GTP cyclohydrolase  79.55 
 
 		 281 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0331  putative GTP cyclohydrolase  79.7 
 
 		 266 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0841  putative GTP cyclohydrolase  79.7 
 
 		 266 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3947  putative GTP cyclohydrolase  78.2 
 
 		 268 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2134  GTP cyclohydrolase  60.55 
 
 		 266 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000813269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0830  hypothetical protein  61.72 
 
 		 270 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3062  GTP cyclohydrolase  58.62 
 
 		 270 aa  332  5e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000921807  unclonable  0.000000032257 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0878  GTP cyclohydrolase  57.09 
 
 		 269 aa  330  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.76872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1773  putative GTP cyclohydrolase  58.05 
 
 		 269 aa  322  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213945  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1052  protein of unknown function DUF198  60.94 
 
 		 268 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0237  hypothetical protein  57.95 
 
 		 263 aa  315  4e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.703325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0944  putative GTP cyclohydrolase  58.2 
 
 		 273 aa  314  9e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2039  hypothetical protein  56.18 
 
 		 267 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.868554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0489  GTP cyclohydrolase  59.76 
 
 		 266 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1703  hypothetical protein  55.27 
 
 		 275 aa  305  4.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2630  GTP cyclohydrolase  53.33 
 
 		 300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0272371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1986  putative GTP cyclohydrolase  56.42 
 
 		 259 aa  302  5.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2318  hypothetical protein  55.34 
 
 		 268 aa  295  6e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1421  protein of unknown function DUF198  54.55 
 
 		 275 aa  290  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1641  protein of unknown function DUF198  51.75 
 
 		 264 aa  288  8e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1973  conserved hypothetical protein TIGR00294  51.75 
 
 		 264 aa  288  8e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1766  GTP cyclohydrolase  49.43 
 
 		 269 aa  271  6e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0484  putative GTP cyclohydrolase  50.97 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3074  putative GTP cyclohydrolase  51.36 
 
 		 261 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0544454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1681  protein of unknown function DUF198  49.8 
 
 		 263 aa  258  6e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4045  putative GTP cyclohydrolase  48.46 
 
 		 285 aa  249  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.96035  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3787  putative GTP cyclohydrolase  50.39 
 
 		 267 aa  247  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3692  putative GTP cyclohydrolase  49.61 
 
 		 267 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2224  hypothetical protein  46.25 
 
 		 260 aa  246  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4100  hypothetical protein  46.51 
 
 		 257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0093  protein of unknown function DUF198  48.46 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0457  putative GTP cyclohydrolase  47.47 
 
 		 266 aa  241  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3275  putative GTP cyclohydrolase  45.42 
 
 		 276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0531  hypothetical protein  44.53 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0441  putative GTP cyclohydrolase  41.9 
 
 		 256 aa  218  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2981  putative GTP cyclohydrolase  43.87 
 
 		 269 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0620  hypothetical protein  42.58 
 
 		 261 aa  216  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0209  putative GTP cyclohydrolase  42.91 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0906  putative GTP cyclohydrolase  40.94 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.131356  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0884  putative GTP cyclohydrolase  40.94 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.310056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0615  putative GTP cyclohydrolase  43.58 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1766  putative GTP cyclohydrolase  42.13 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1321  putative GTP cyclohydrolase  42.47 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0144328 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0473  putative GTP cyclohydrolase  43.31 
 
 		 266 aa  201  9e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2957  putative GTP cyclohydrolase  41.41 
 
 		 256 aa  194  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133521  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3230  putative GTP cyclohydrolase  41.73 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1269  protein of unknown function DUF198  40.62 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000812404  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0212  putative GTP cyclohydrolase  36.98 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0589  putative GTP cyclohydrolase  35.47 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0603  putative GTP cyclohydrolase  35.47 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0781  protein of unknown function DUF198  30.99 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.783967  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1183  GTP cyclohydrolase  29.47 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0355  GTP cyclohydrolase  30.85 
 
 		 322 aa  99  8e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.498467  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2312  GTP cyclohydrolase I  28.89 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0579  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  28.67 
 
 		 480 aa  95.5  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0018  GTP cyclohydrolase  29.43 
 
 		 311 aa  95.5  9e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2334  GTP cyclohydrolase  27.8 
 
 		 328 aa  92.8  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.163269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0083  GTP cyclohydrolase  27.7 
 
 		 317 aa  92  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0054  GTP cyclohydrolase  30.07 
 
 		 317 aa  91.3  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2173  GTP cyclohydrolase  26.76 
 
 		 313 aa  90.1  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4297  putative GTP cyclohydrolase  28.73 
 
 		 321 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1583  GTP cyclohydrolase  28.38 
 
 		 309 aa  88.2  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1875  putative GTP cyclohydrolase  24.83 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1031  GTP cyclohydrolase  29.67 
 
 		 312 aa  87.4  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.489752  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1031  GTP cyclohydrolase  29.33 
 
 		 315 aa  86.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59743  hitchhiker  0.00756508 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1567  putative GTP cyclohydrolase  25.57 
 
 		 327 aa  86.7  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0199115  normal  0.180744 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2853  protein of unknown function DUF198  26.12 
 
 		 310 aa  86.3  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2276  GTP cyclohydrolase  25.77 
 
 		 309 aa  85.5  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.593749  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2260  GTP cyclohydrolase  26 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2411  putative GTP cyclohydrolase  27.21 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.556277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0915  GTP cyclohydrolase  28.38 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.599141  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0480  GTP cyclohydrolase  27.46 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00695  putative GTP cyclohydrolase  26.69 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24848  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1148  GTP cyclohydrolase  27.76 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.713445  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1857  putative GTP cyclohydrolase  30.35 
 
 		 362 aa  82  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0639  putative GTP cyclohydrolase  28.06 
 
 		 359 aa  82  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473028  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1937  putative GTP cyclohydrolase  26.88 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5367  protein of unknown function DUF198  26.28 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4498  putative GTP cyclohydrolase  22.82 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0488  protein of unknown function DUF198  25.43 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0923  putative GTP cyclohydrolase  24.41 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134709  normal  0.123091 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>