127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0830 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0830  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2039  hypothetical protein  75.37 
 
 		 267 aa  425  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.868554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3062  GTP cyclohydrolase  73.75 
 
 		 270 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000921807  unclonable  0.000000032257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0944  putative GTP cyclohydrolase  72.73 
 
 		 273 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2134  GTP cyclohydrolase  74.02 
 
 		 266 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000813269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1986  putative GTP cyclohydrolase  73.44 
 
 		 259 aa  401  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1773  putative GTP cyclohydrolase  70.94 
 
 		 269 aa  397  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213945  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0878  GTP cyclohydrolase  69.78 
 
 		 269 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.76872  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2318  hypothetical protein  68.11 
 
 		 268 aa  363  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0237  hypothetical protein  66.02 
 
 		 263 aa  361  5.0000000000000005e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.703325  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6780  putative GTP cyclohydrolase  63.57 
 
 		 268 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849591  hitchhiker  0.000971537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2826  putative GTP cyclohydrolase  64.34 
 
 		 268 aa  352  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0331  putative GTP cyclohydrolase  63.42 
 
 		 266 aa  349  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0841  putative GTP cyclohydrolase  63.42 
 
 		 266 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2210  putative GTP cyclohydrolase  63.67 
 
 		 269 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1514  putative GTP cyclohydrolase  63.42 
 
 		 277 aa  349  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1707  putative GTP cyclohydrolase  63.42 
 
 		 269 aa  349  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2533  putative GTP cyclohydrolase  63.42 
 
 		 269 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2391  putative GTP cyclohydrolase  63.42 
 
 		 269 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.075557  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0366  putative GTP cyclohydrolase  63.42 
 
 		 281 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0615  putative GTP cyclohydrolase  63.67 
 
 		 277 aa  349  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4819  putative GTP cyclohydrolase  63.67 
 
 		 269 aa  347  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3251  putative GTP cyclohydrolase  63.67 
 
 		 269 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3947  putative GTP cyclohydrolase  64.06 
 
 		 268 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4485  putative GTP cyclohydrolase  63.28 
 
 		 269 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3880  putative GTP cyclohydrolase  63.28 
 
 		 269 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3647  putative GTP cyclohydrolase  63.28 
 
 		 269 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3777  putative GTP cyclohydrolase  63.67 
 
 		 269 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730227  normal  0.0392269 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1973  conserved hypothetical protein TIGR00294  61.33 
 
 		 264 aa  340  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1641  protein of unknown function DUF198  61.33 
 
 		 264 aa  340  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0883  putative GTP cyclohydrolase  59.7 
 
 		 270 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1766  GTP cyclohydrolase  60.47 
 
 		 269 aa  333  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2614  putative GTP cyclohydrolase  57.46 
 
 		 267 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.307548  normal  0.812477 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2220  putative GTP cyclohydrolase  61.72 
 
 		 268 aa  321  7e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2425  putative GTP cyclohydrolase  60.7 
 
 		 268 aa  319  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2032  putative GTP cyclohydrolase  60.31 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.527904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0484  putative GTP cyclohydrolase  57.81 
 
 		 258 aa  316  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3074  putative GTP cyclohydrolase  56.25 
 
 		 261 aa  314  9e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0544454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4045  putative GTP cyclohydrolase  56.82 
 
 		 285 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.96035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3275  putative GTP cyclohydrolase  55.64 
 
 		 276 aa  307  9e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0489  GTP cyclohydrolase  57.77 
 
 		 266 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3787  putative GTP cyclohydrolase  55.21 
 
 		 267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1052  protein of unknown function DUF198  56.64 
 
 		 268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3692  putative GTP cyclohydrolase  54.44 
 
 		 267 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0457  putative GTP cyclohydrolase  54.62 
 
 		 266 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4100  hypothetical protein  54.02 
 
 		 257 aa  293  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2981  putative GTP cyclohydrolase  54.94 
 
 		 269 aa  293  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2224  hypothetical protein  54.55 
 
 		 260 aa  287  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0093  protein of unknown function DUF198  52.71 
 
 		 264 aa  276  3e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0531  hypothetical protein  49.02 
 
 		 259 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1703  hypothetical protein  48.55 
 
 		 275 aa  266  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1681  protein of unknown function DUF198  51.75 
 
 		 263 aa  262  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1421  protein of unknown function DUF198  50 
 
 		 275 aa  260  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0209  putative GTP cyclohydrolase  48.82 
 
 		 264 aa  256  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2630  GTP cyclohydrolase  47.16 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0272371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0620  hypothetical protein  48.05 
 
 		 261 aa  255  6e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0441  putative GTP cyclohydrolase  47.04 
 
 		 256 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2957  putative GTP cyclohydrolase  47.66 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133521  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0473  putative GTP cyclohydrolase  47.64 
 
 		 266 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0884  putative GTP cyclohydrolase  48.03 
 
 		 259 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.310056  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0906  putative GTP cyclohydrolase  48.03 
 
 		 259 aa  241  9e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.131356  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1766  putative GTP cyclohydrolase  46.48 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0615  putative GTP cyclohydrolase  45.28 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1321  putative GTP cyclohydrolase  46.27 
 
 		 259 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0144328 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3230  putative GTP cyclohydrolase  44.88 
 
 		 274 aa  224  9e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1269  protein of unknown function DUF198  39.44 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000812404  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0212  putative GTP cyclohydrolase  34.34 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0589  putative GTP cyclohydrolase  33.97 
 
 		 292 aa  158  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0603  putative GTP cyclohydrolase  33.97 
 
 		 292 aa  158  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1852  putative GTP cyclohydrolase  28.1 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0501  putative GTP cyclohydrolase  28.1 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0639  putative GTP cyclohydrolase  27.74 
 
 		 359 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473028  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2334  GTP cyclohydrolase  26.76 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.163269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5367  protein of unknown function DUF198  28.77 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2312  GTP cyclohydrolase I  26.91 
 
 		 359 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0480  GTP cyclohydrolase  27.74 
 
 		 326 aa  98.6  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2173  GTP cyclohydrolase  26.51 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1183  GTP cyclohydrolase  28.38 
 
 		 319 aa  97.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0083  GTP cyclohydrolase  27.54 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0781  protein of unknown function DUF198  29.62 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.783967  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2276  GTP cyclohydrolase  26.69 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.593749  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0579  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  26.74 
 
 		 480 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4297  putative GTP cyclohydrolase  26.91 
 
 		 321 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1857  putative GTP cyclohydrolase  28.52 
 
 		 362 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229026 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1937  putative GTP cyclohydrolase  27.67 
 
 		 367 aa  94  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0018  GTP cyclohydrolase  27.39 
 
 		 311 aa  94  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1567  putative GTP cyclohydrolase  25.36 
 
 		 327 aa  93.6  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0199115  normal  0.180744 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0556  hypothetical protein  24.6 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2853  protein of unknown function DUF198  26.35 
 
 		 310 aa  93.2  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2411  putative GTP cyclohydrolase  26.88 
 
 		 367 aa  92  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.556277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0488  protein of unknown function DUF198  26.1 
 
 		 310 aa  90.1  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0355  GTP cyclohydrolase  28.72 
 
 		 322 aa  90.1  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.498467  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1583  GTP cyclohydrolase  27.42 
 
 		 309 aa  88.2  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4498  putative GTP cyclohydrolase  24.43 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2260  GTP cyclohydrolase  26.6 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5412  putative GTP cyclohydrolase  25.68 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.320234  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0923  putative GTP cyclohydrolase  24.83 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134709  normal  0.123091 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1148  GTP cyclohydrolase  29.43 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.713445  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5141  putative GTP cyclohydrolase  24.91 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.780092 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1031  GTP cyclohydrolase  27.74 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.489752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>