124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1973 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1973  conserved hypothetical protein TIGR00294  100 
 
 		 264 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1641  protein of unknown function DUF198  100 
 
 		 264 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2039  hypothetical protein  62.89 
 
 		 267 aa  342  4e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.868554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0830  hypothetical protein  61.33 
 
 		 270 aa  340  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3062  GTP cyclohydrolase  60.16 
 
 		 270 aa  333  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000921807  unclonable  0.000000032257 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2134  GTP cyclohydrolase  57.95 
 
 		 266 aa  333  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000813269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2318  hypothetical protein  60.94 
 
 		 268 aa  329  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0944  putative GTP cyclohydrolase  58.59 
 
 		 273 aa  324  9e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1773  putative GTP cyclohydrolase  59.53 
 
 		 269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213945  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0878  GTP cyclohydrolase  59.54 
 
 		 269 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.76872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0237  hypothetical protein  57.98 
 
 		 263 aa  316  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.703325  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1766  GTP cyclohydrolase  56.13 
 
 		 269 aa  311  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716669 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1986  putative GTP cyclohydrolase  57.42 
 
 		 259 aa  311  5.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3947  putative GTP cyclohydrolase  55.64 
 
 		 268 aa  308  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4819  putative GTP cyclohydrolase  56.42 
 
 		 269 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2210  putative GTP cyclohydrolase  56.81 
 
 		 269 aa  305  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6780  putative GTP cyclohydrolase  55.64 
 
 		 268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849591  hitchhiker  0.000971537 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4485  putative GTP cyclohydrolase  56.81 
 
 		 269 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3251  putative GTP cyclohydrolase  57.2 
 
 		 269 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3880  putative GTP cyclohydrolase  56.81 
 
 		 269 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3647  putative GTP cyclohydrolase  56.81 
 
 		 269 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3777  putative GTP cyclohydrolase  57.2 
 
 		 269 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730227  normal  0.0392269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1052  protein of unknown function DUF198  56.59 
 
 		 268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0615  putative GTP cyclohydrolase  55.25 
 
 		 277 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2826  putative GTP cyclohydrolase  55.25 
 
 		 268 aa  300  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1514  putative GTP cyclohydrolase  55.08 
 
 		 277 aa  298  8e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1707  putative GTP cyclohydrolase  55.08 
 
 		 269 aa  298  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2533  putative GTP cyclohydrolase  55.08 
 
 		 269 aa  298  8e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2391  putative GTP cyclohydrolase  55.08 
 
 		 269 aa  298  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.075557  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0366  putative GTP cyclohydrolase  55.08 
 
 		 281 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0331  putative GTP cyclohydrolase  55.08 
 
 		 266 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0841  putative GTP cyclohydrolase  55.08 
 
 		 266 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2614  putative GTP cyclohydrolase  54.09 
 
 		 267 aa  291  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.307548  normal  0.812477 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0883  putative GTP cyclohydrolase  51.36 
 
 		 270 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0484  putative GTP cyclohydrolase  51.17 
 
 		 258 aa  281  9e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0489  GTP cyclohydrolase  53.97 
 
 		 266 aa  279  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4045  putative GTP cyclohydrolase  50.39 
 
 		 285 aa  279  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.96035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4100  hypothetical protein  49.8 
 
 		 257 aa  278  6e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2981  putative GTP cyclohydrolase  52.17 
 
 		 269 aa  276  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3074  putative GTP cyclohydrolase  49.22 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0544454  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2220  putative GTP cyclohydrolase  51.75 
 
 		 268 aa  275  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2032  putative GTP cyclohydrolase  51.95 
 
 		 268 aa  275  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.527904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3787  putative GTP cyclohydrolase  50.2 
 
 		 267 aa  275  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2425  putative GTP cyclohydrolase  51.56 
 
 		 268 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3692  putative GTP cyclohydrolase  50.2 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3275  putative GTP cyclohydrolase  48.84 
 
 		 276 aa  270  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2224  hypothetical protein  50.2 
 
 		 260 aa  268  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0457  putative GTP cyclohydrolase  48.83 
 
 		 266 aa  268  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0093  protein of unknown function DUF198  51.16 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1681  protein of unknown function DUF198  51.37 
 
 		 263 aa  258  5.0000000000000005e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0531  hypothetical protein  44.27 
 
 		 259 aa  256  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1703  hypothetical protein  49.81 
 
 		 275 aa  248  8e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0209  putative GTP cyclohydrolase  46.46 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1766  putative GTP cyclohydrolase  47.83 
 
 		 260 aa  242  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0620  hypothetical protein  46.92 
 
 		 261 aa  242  6e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0615  putative GTP cyclohydrolase  43.48 
 
 		 257 aa  238  9e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0441  putative GTP cyclohydrolase  45.1 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1421  protein of unknown function DUF198  48.67 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2630  GTP cyclohydrolase  46.5 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0272371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0906  putative GTP cyclohydrolase  43.87 
 
 		 259 aa  226  4e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.131356  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0884  putative GTP cyclohydrolase  43.48 
 
 		 259 aa  224  8e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.310056  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0473  putative GTP cyclohydrolase  44.27 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2957  putative GTP cyclohydrolase  43.75 
 
 		 256 aa  218  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133521  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1321  putative GTP cyclohydrolase  43.14 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0144328 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3230  putative GTP cyclohydrolase  42.69 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1269  protein of unknown function DUF198  36.36 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000812404  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0589  putative GTP cyclohydrolase  32.58 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0603  putative GTP cyclohydrolase  32.58 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0212  putative GTP cyclohydrolase  32.08 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5367  protein of unknown function DUF198  30.93 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1852  putative GTP cyclohydrolase  32.14 
 
 		 359 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0501  putative GTP cyclohydrolase  32.14 
 
 		 359 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0639  putative GTP cyclohydrolase  32.54 
 
 		 359 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473028  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2312  GTP cyclohydrolase I  31.72 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2411  putative GTP cyclohydrolase  30.16 
 
 		 367 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.556277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1937  putative GTP cyclohydrolase  32.14 
 
 		 367 aa  99.8  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0781  protein of unknown function DUF198  29.5 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.783967  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1567  putative GTP cyclohydrolase  28.06 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0199115  normal  0.180744 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2853  protein of unknown function DUF198  27.76 
 
 		 310 aa  96.3  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4297  putative GTP cyclohydrolase  30.68 
 
 		 321 aa  95.5  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0579  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  26.78 
 
 		 480 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0488  protein of unknown function DUF198  27.55 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0083  GTP cyclohydrolase  28.86 
 
 		 317 aa  90.9  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2260  GTP cyclohydrolase  27.03 
 
 		 340 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2276  GTP cyclohydrolase  27.4 
 
 		 309 aa  89.7  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.593749  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1857  putative GTP cyclohydrolase  28.8 
 
 		 362 aa  88.2  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229026 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0018  GTP cyclohydrolase  26.33 
 
 		 311 aa  86.7  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1183  GTP cyclohydrolase  26.91 
 
 		 319 aa  85.9  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2334  GTP cyclohydrolase  26.17 
 
 		 328 aa  85.9  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.163269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2173  GTP cyclohydrolase  26.85 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1583  GTP cyclohydrolase  25.61 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0480  GTP cyclohydrolase  27.85 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0556  hypothetical protein  25.69 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1031  GTP cyclohydrolase  28.2 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.489752  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1031  GTP cyclohydrolase  27.76 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59743  hitchhiker  0.00756508 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1099  putative GTP cyclohydrolase  25.52 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0121166 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0923  putative GTP cyclohydrolase  23.93 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134709  normal  0.123091 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0355  GTP cyclohydrolase  29.33 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.498467  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0915  GTP cyclohydrolase  27.87 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.599141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3324  putative GTP cyclohydrolase  26.39 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109803 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>