127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0906 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0906  putative GTP cyclohydrolase  100 
 
 		 259 aa  532  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.131356  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0884  putative GTP cyclohydrolase  99.23 
 
 		 259 aa  529  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.310056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0615  putative GTP cyclohydrolase  61.66 
 
 		 257 aa  340  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0441  putative GTP cyclohydrolase  57.37 
 
 		 256 aa  316  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0531  hypothetical protein  56.52 
 
 		 259 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0620  hypothetical protein  53.57 
 
 		 261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3692  putative GTP cyclohydrolase  48.43 
 
 		 267 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3787  putative GTP cyclohydrolase  48.03 
 
 		 267 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4045  putative GTP cyclohydrolase  49.01 
 
 		 285 aa  256  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.96035  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2224  hypothetical protein  46.88 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4100  hypothetical protein  48.83 
 
 		 257 aa  251  5.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0484  putative GTP cyclohydrolase  47.83 
 
 		 258 aa  251  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3275  putative GTP cyclohydrolase  48.41 
 
 		 276 aa  250  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0457  putative GTP cyclohydrolase  49.01 
 
 		 266 aa  248  7e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2981  putative GTP cyclohydrolase  48.02 
 
 		 269 aa  246  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2039  hypothetical protein  46.85 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.868554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3074  putative GTP cyclohydrolase  47.43 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0544454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0878  GTP cyclohydrolase  49.01 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.76872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1766  GTP cyclohydrolase  45.88 
 
 		 269 aa  242  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716669 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0830  hypothetical protein  48.03 
 
 		 270 aa  241  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0944  putative GTP cyclohydrolase  47.83 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0237  hypothetical protein  46.25 
 
 		 263 aa  236  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.703325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1773  putative GTP cyclohydrolase  47.43 
 
 		 269 aa  235  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213945  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3062  GTP cyclohydrolase  46.83 
 
 		 270 aa  234  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000921807  unclonable  0.000000032257 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2134  GTP cyclohydrolase  47.24 
 
 		 266 aa  234  9e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000813269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2957  putative GTP cyclohydrolase  46.48 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133521  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0473  putative GTP cyclohydrolase  46.85 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1973  conserved hypothetical protein TIGR00294  43.87 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1641  protein of unknown function DUF198  43.87 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1986  putative GTP cyclohydrolase  44.09 
 
 		 259 aa  222  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1321  putative GTP cyclohydrolase  44.88 
 
 		 259 aa  222  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0144328 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0093  protein of unknown function DUF198  45 
 
 		 264 aa  222  4e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2318  hypothetical protein  44.09 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0209  putative GTP cyclohydrolase  44.75 
 
 		 264 aa  221  6e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2826  putative GTP cyclohydrolase  44.09 
 
 		 268 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1766  putative GTP cyclohydrolase  44.49 
 
 		 260 aa  218  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1269  protein of unknown function DUF198  46.61 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000812404  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6780  putative GTP cyclohydrolase  43.31 
 
 		 268 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849591  hitchhiker  0.000971537 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1514  putative GTP cyclohydrolase  43.7 
 
 		 277 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0366  putative GTP cyclohydrolase  43.7 
 
 		 281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1707  putative GTP cyclohydrolase  43.7 
 
 		 269 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2533  putative GTP cyclohydrolase  43.7 
 
 		 269 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2391  putative GTP cyclohydrolase  43.7 
 
 		 269 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.075557  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0331  putative GTP cyclohydrolase  43.7 
 
 		 266 aa  214  8e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0841  putative GTP cyclohydrolase  43.7 
 
 		 266 aa  214  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0615  putative GTP cyclohydrolase  43.7 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4819  putative GTP cyclohydrolase  43.7 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0489  GTP cyclohydrolase  43.82 
 
 		 266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1052  protein of unknown function DUF198  41.73 
 
 		 268 aa  212  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2210  putative GTP cyclohydrolase  43.31 
 
 		 269 aa  211  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3947  putative GTP cyclohydrolase  43.7 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3251  putative GTP cyclohydrolase  43.31 
 
 		 269 aa  208  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4485  putative GTP cyclohydrolase  42.91 
 
 		 269 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3880  putative GTP cyclohydrolase  42.91 
 
 		 269 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3647  putative GTP cyclohydrolase  42.91 
 
 		 269 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3777  putative GTP cyclohydrolase  43.31 
 
 		 269 aa  207  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730227  normal  0.0392269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2614  putative GTP cyclohydrolase  42.91 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.307548  normal  0.812477 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3230  putative GTP cyclohydrolase  41.8 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0883  putative GTP cyclohydrolase  42.02 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2032  putative GTP cyclohydrolase  40.94 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.527904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2425  putative GTP cyclohydrolase  40.94 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2220  putative GTP cyclohydrolase  40.94 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2630  GTP cyclohydrolase  42.05 
 
 		 300 aa  198  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0272371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1703  hypothetical protein  42.41 
 
 		 275 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1681  protein of unknown function DUF198  40.23 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1421  protein of unknown function DUF198  41.25 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0589  putative GTP cyclohydrolase  36.15 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0603  putative GTP cyclohydrolase  36.15 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0212  putative GTP cyclohydrolase  36.64 
 
 		 292 aa  141  8e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0579  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30.1 
 
 		 480 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0639  putative GTP cyclohydrolase  28.78 
 
 		 359 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473028  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2411  putative GTP cyclohydrolase  29.02 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.556277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1852  putative GTP cyclohydrolase  27.8 
 
 		 359 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0501  putative GTP cyclohydrolase  27.8 
 
 		 359 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1937  putative GTP cyclohydrolase  27.17 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4297  putative GTP cyclohydrolase  26.2 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0781  protein of unknown function DUF198  31.41 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.783967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0556  hypothetical protein  26.91 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5367  protein of unknown function DUF198  29.31 
 
 		 333 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1857  putative GTP cyclohydrolase  25.19 
 
 		 362 aa  95.5  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1567  putative GTP cyclohydrolase  28.08 
 
 		 327 aa  95.5  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0199115  normal  0.180744 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1183  GTP cyclohydrolase  28.38 
 
 		 319 aa  89.7  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0355  GTP cyclohydrolase  28.14 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.498467  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2312  GTP cyclohydrolase I  25.78 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0083  GTP cyclohydrolase  26.17 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2173  GTP cyclohydrolase  25 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1148  GTP cyclohydrolase  28.08 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.713445  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1031  GTP cyclohydrolase  29.83 
 
 		 312 aa  82  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.489752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2334  GTP cyclohydrolase  24.75 
 
 		 328 aa  82  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.163269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1099  putative GTP cyclohydrolase  25.43 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0121166 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0915  GTP cyclohydrolase  30.67 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.599141  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1583  GTP cyclohydrolase  24.92 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1646  GTP cyclohydrolase  31.5 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.333029  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1031  GTP cyclohydrolase  30.33 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59743  hitchhiker  0.00756508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5141  putative GTP cyclohydrolase  25.34 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.780092 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2853  protein of unknown function DUF198  26.71 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0488  protein of unknown function DUF198  26.03 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2260  GTP cyclohydrolase  25.26 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1875  putative GTP cyclohydrolase  24.92 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2276  GTP cyclohydrolase  26.37 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.593749  normal  0.169776 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>