120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2439 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2439  protein of unknown function DUF198  100 
 
 		 314 aa  628  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0191  putative GTP cyclohydrolase  54.7 
 
 		 304 aa  311  6.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5141  putative GTP cyclohydrolase  56.69 
 
 		 295 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.780092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5658  putative GTP cyclohydrolase  54.67 
 
 		 298 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73050  putative GTP cyclohydrolase  58.8 
 
 		 298 aa  289  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.131305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6341  putative GTP cyclohydrolase  58.45 
 
 		 298 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5412  putative GTP cyclohydrolase  55.28 
 
 		 301 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.320234  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4538  putative GTP cyclohydrolase  55.99 
 
 		 296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0923  putative GTP cyclohydrolase  47.65 
 
 		 306 aa  260  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134709  normal  0.123091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4498  putative GTP cyclohydrolase  44.88 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2628  putative GTP cyclohydrolase  52.04 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.10548  normal  0.526872 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1875  putative GTP cyclohydrolase  43.85 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1099  putative GTP cyclohydrolase  45.54 
 
 		 324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0121166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2578  hypothetical protein  47.14 
 
 		 301 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176733  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0301  putative GTP cyclohydrolase  43.49 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.624443  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29210  putative GTP cyclohydrolase  46.78 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3650  putative GTP cyclohydrolase  47.23 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0929  putative GTP cyclohydrolase  46.58 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0825  putative GTP cyclohydrolase  46.23 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600623  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2269  putative GTP cyclohydrolase  44.88 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.660602  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3324  putative GTP cyclohydrolase  45.92 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0317  putative GTP cyclohydrolase  47.67 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2420  putative GTP cyclohydrolase  46.13 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3035  putative GTP cyclohydrolase  48 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.072271  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5331  putative GTP cyclohydrolase  48 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.631653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4937  putative GTP cyclohydrolase  48.64 
 
 		 306 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233652  normal  0.418134 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00695  putative GTP cyclohydrolase  45.58 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24848  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2312  GTP cyclohydrolase I  33.01 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4297  putative GTP cyclohydrolase  31.16 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1937  putative GTP cyclohydrolase  28.52 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0639  putative GTP cyclohydrolase  29.11 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473028  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1852  putative GTP cyclohydrolase  29.11 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0501  putative GTP cyclohydrolase  29.11 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1857  putative GTP cyclohydrolase  29.93 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229026 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2411  putative GTP cyclohydrolase  27.52 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.556277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1567  putative GTP cyclohydrolase  30.41 
 
 		 327 aa  95.5  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0199115  normal  0.180744 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0473  putative GTP cyclohydrolase  27.03 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1681  protein of unknown function DUF198  27 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2039  hypothetical protein  25.32 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.868554  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1321  putative GTP cyclohydrolase  26.44 
 
 		 259 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0144328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0944  putative GTP cyclohydrolase  26.54 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3275  putative GTP cyclohydrolase  28.1 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0830  hypothetical protein  25.34 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3947  putative GTP cyclohydrolase  26.56 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2134  GTP cyclohydrolase  25.67 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000813269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1766  putative GTP cyclohydrolase  25.33 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3074  putative GTP cyclohydrolase  24.75 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0544454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4100  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1703  hypothetical protein  25.83 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2981  putative GTP cyclohydrolase  25.52 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3230  putative GTP cyclohydrolase  26.8 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3787  putative GTP cyclohydrolase  26.78 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2224  hypothetical protein  25.34 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3777  putative GTP cyclohydrolase  26.62 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730227  normal  0.0392269 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0093  protein of unknown function DUF198  27.42 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3692  putative GTP cyclohydrolase  26.78 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0212  putative GTP cyclohydrolase  22.08 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0878  GTP cyclohydrolase  25.42 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.76872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2276  GTP cyclohydrolase  28.01 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.593749  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0906  putative GTP cyclohydrolase  24.16 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.131356  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3062  GTP cyclohydrolase  23.41 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000921807  unclonable  0.000000032257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3251  putative GTP cyclohydrolase  26.28 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1773  putative GTP cyclohydrolase  26.67 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213945  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2210  putative GTP cyclohydrolase  26.17 
 
 		 269 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0884  putative GTP cyclohydrolase  24.16 
 
 		 259 aa  67  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.310056  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4485  putative GTP cyclohydrolase  25.68 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3880  putative GTP cyclohydrolase  25.68 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3647  putative GTP cyclohydrolase  25.68 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0484  putative GTP cyclohydrolase  25.25 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1766  GTP cyclohydrolase  24.57 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716669 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2957  putative GTP cyclohydrolase  23.81 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4045  putative GTP cyclohydrolase  26.48 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.96035  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0457  putative GTP cyclohydrolase  27.06 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6780  putative GTP cyclohydrolase  25.08 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849591  hitchhiker  0.000971537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2826  putative GTP cyclohydrolase  25.08 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1641  protein of unknown function DUF198  25 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1973  conserved hypothetical protein TIGR00294  25 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0883  putative GTP cyclohydrolase  24.58 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0589  putative GTP cyclohydrolase  21.43 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0603  putative GTP cyclohydrolase  21.43 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4819  putative GTP cyclohydrolase  25.17 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2318  hypothetical protein  25.76 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0209  putative GTP cyclohydrolase  25.68 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1986  putative GTP cyclohydrolase  25.34 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1421  protein of unknown function DUF198  26.76 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1183  GTP cyclohydrolase  21.86 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0480  GTP cyclohydrolase  24.76 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1052  protein of unknown function DUF198  27.65 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0237  hypothetical protein  23.71 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.703325  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0441  putative GTP cyclohydrolase  20.53 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0615  putative GTP cyclohydrolase  24.1 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2425  putative GTP cyclohydrolase  24.05 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2220  putative GTP cyclohydrolase  24.05 
 
 		 268 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0531  hypothetical protein  20.2 
 
 		 259 aa  57  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2614  putative GTP cyclohydrolase  24.05 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.307548  normal  0.812477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2032  putative GTP cyclohydrolase  23.71 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.527904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0615  putative GTP cyclohydrolase  23.89 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2630  GTP cyclohydrolase  27.91 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0272371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0083  GTP cyclohydrolase  23.15 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2533  putative GTP cyclohydrolase  25.33 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>