178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6081 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6081  phosphatidylserine decarboxylase-related  100 
 
 
416 aa  859    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.134121 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1338  phosphatidylserine decarboxylase-related  99.04 
 
 
437 aa  852    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305133  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5602  phosphatidylserine decarboxylase-related  86.78 
 
 
415 aa  738    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6491  phosphatidylserine decarboxylase-related  99.28 
 
 
437 aa  854    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00510821  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5484  phosphatidylserine decarboxylase-related  81.73 
 
 
413 aa  687    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459221 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6332  phosphatidylserine decarboxylase-related  87.02 
 
 
415 aa  741    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0687307 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1997  putative phosphatidylserine decarboxylase  69.11 
 
 
433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1018  putative phosphatidylserine decarboxylase  69.11 
 
 
433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1306  putative phosphatidylserine decarboxylase  69.11 
 
 
433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3176  putative phosphatidylserine decarboxylase  68.86 
 
 
430 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2283  putative phosphatidylserine decarboxylase  69.11 
 
 
433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.808737  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0076  putative phosphatidylserine decarboxylase  63.94 
 
 
416 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.946324  hitchhiker  0.00170285 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1394  phosphatidylserine decarboxylase precursor  68.46 
 
 
433 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3048  putative phosphatidylserine decarboxylase  68.72 
 
 
433 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65507  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5255  phosphatidylserine decarboxylase-related  60.2 
 
 
416 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0410798 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1269  phosphatidylserine decarboxylase-related  42.05 
 
 
436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00492454  normal  0.0230075 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11161  phosphatidylserine decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01730)  37.87 
 
 
446 aa  273  5.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08120  Phosphatidylserine decarboxylase, putative  37.84 
 
 
436 aa  271  2e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4860  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  38.83 
 
 
430 aa  270  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0399088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4108  phosphatidylserine decarboxylase-related  36.38 
 
 
456 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1617  hypothetical protein  96.12 
 
 
159 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0966  phosphatidylserine decarboxylase-related  32.27 
 
 
474 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0979  phosphatidylserine decarboxylase-related  34.01 
 
 
474 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3578  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  29.86 
 
 
417 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142154  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40695  phosphatidylserine decarboxylase  34.48 
 
 
1064 aa  113  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350595  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  33.67 
 
 
1264 aa  109  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03188  phosphatidylserine decarboxylase Psd2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13970)  31.07 
 
 
1053 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.927453 
 
 
-
 
NC_006686  CND04930  conserved hypothetical protein  33.81 
 
 
409 aa  101  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20791  hypothetical protein  25.43 
 
 
397 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07385  conserved hypothetical protein  31.02 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0033  phosphatidylserine decarboxylase  29.74 
 
 
294 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.484885  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0033  phosphatidylserine decarboxylase  26.45 
 
 
294 aa  90.5  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0072  phosphatidylserine decarboxylase  31.5 
 
 
301 aa  88.6  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1772  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  32.09 
 
 
392 aa  87  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.839794  normal  0.123461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1976  phosphatidylserine decarboxylase  32.2 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.129589 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07989  phosphatidylserine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16930)  28.97 
 
 
347 aa  84  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167037  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  27.54 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3539  phosphatidylserine decarboxylase  28.02 
 
 
298 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100756  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4189  phosphatidylserine decarboxylase  31.8 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1551  phosphatidylserine decarboxylase-related  25.93 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal  0.0668406 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1652  phosphatidylserine decarboxylase-related  33 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.178004 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3064  phosphatidylserine decarboxylase  30.73 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0779  phosphatidylserine decarboxylase  32.11 
 
 
262 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00256748 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4419  phosphatidylserine decarboxylase  31.19 
 
 
254 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4235  phosphatidylserine decarboxylase  31.19 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4565  phosphatidylserine decarboxylase  31.19 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4083  phosphatidylserine decarboxylase  31.19 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4458  phosphatidylserine decarboxylase  31.65 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.183359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4360  phosphatidylserine decarboxylase  31.19 
 
 
262 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4471  phosphatidylserine decarboxylase  31.19 
 
 
262 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4073  phosphatidylserine decarboxylase  31.82 
 
 
262 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.293375  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  28.9 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  28.91 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0989  phosphatidylserine decarboxylase  29 
 
 
264 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  28.63 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  28.52 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  28.63 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  28.63 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  28.52 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  28.91 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1332  phosphatidylserine decarboxylase  31.28 
 
 
259 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1846  phosphatidylserine decarboxylase  29.25 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.028301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  28.52 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  27.52 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4806  phosphatidylserine decarboxylase  29.47 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  28.32 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  28.12 
 
 
292 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  28.93 
 
 
289 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  28.12 
 
 
292 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  28.12 
 
 
292 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  28.12 
 
 
292 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  27.52 
 
 
282 aa  67  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  27.86 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  25.45 
 
 
325 aa  65.1  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  27.6 
 
 
286 aa  64.3  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3747  phosphatidylserine decarboxylase  29.26 
 
 
296 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0603  phosphatidylserine decarboxylase-related  29.09 
 
 
329 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  26.44 
 
 
288 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  30.56 
 
 
288 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  28.9 
 
 
286 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2462  phosphatidylserine decarboxylase  25 
 
 
259 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0788063  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  29.29 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  28 
 
 
289 aa  61.2  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  25.61 
 
 
303 aa  61.2  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  25.37 
 
 
287 aa  61.2  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2218  phosphatidylserine decarboxylase  29.55 
 
 
277 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.127421  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1650  phosphatidylserine decarboxylase  30.19 
 
 
286 aa  60.1  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2293  phosphatidylserine decarboxylase, putative  47.06 
 
 
111 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  27.64 
 
 
303 aa  59.7  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2876  phosphatidylserine decarboxylase  29.95 
 
 
282 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0824  phosphatidylserine decarboxylase  27.27 
 
 
292 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.088312  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  26.34 
 
 
322 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  28.77 
 
 
283 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  28.77 
 
 
283 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  28.57 
 
 
286 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0422  phosphatidylserine decarboxylase  28.77 
 
 
316 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161477  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  26.34 
 
 
322 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  26.34 
 
 
322 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  26.34 
 
 
322 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4617  phosphatidylserine decarboxylase  26.34 
 
 
322 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0883956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>