More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3153 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_3153  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 271 aa  544  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0769848 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  97.79 
 
 		 271 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2524  alpha/beta hydrolase fold  97.42 
 
 		 271 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191212  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  94.74 
 
 		 267 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3192  alpha/beta hydrolase fold  94.36 
 
 		 267 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  89.67 
 
 		 271 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  56.06 
 
 		 277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  59.7 
 
 		 272 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  59.32 
 
 		 272 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  59.32 
 
 		 272 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  47.35 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  45.52 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  44.36 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  42.54 
 
 		 284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15020  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  42.02 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  38.17 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  31.52 
 
 		 283 aa  99.4  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 314 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  26.18 
 
 		 341 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 340 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  27.44 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  31.21 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  22.18 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  25.28 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4484  alpha/beta hydrolase fold  44.33 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2944  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.765765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4624  alpha/beta fold family hydrolase  44.33 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  28.16 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1797  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696369  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.04 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.62 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0902  Alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  26.98 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.74 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  21.76 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13371  predicted protein  27 
 
 		 323 aa  67  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014385  normal  0.0363767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5672  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  21.26 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0420  alpha/beta hydrolase  25.49 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  24.38 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  21.76 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2923  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27.51 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  26.26 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.41 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0626  Alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  27.15 
 
 		 323 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  24.14 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  24.14 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  26.62 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  26.62 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  26.62 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>