More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3336 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4960  major facilitator transporter  95.04 
 
 		 446 aa  667    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.554381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5253  major facilitator transporter  98.96 
 
 		 446 aa  743    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3336  major facilitator transporter  100 
 
 		 383 aa  752    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00713075  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4440  major facilitator transporter  96.07 
 
 		 446 aa  675    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.827136  hitchhiker  0.000980879 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5031  major facilitator transporter  100 
 
 		 446 aa  751    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.599712  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  83.51 
 
 		 443 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3111  major facilitator transporter  42.46 
 
 		 455 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 436 aa  312  6.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 436 aa  312  6.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  43.31 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  41.21 
 
 		 437 aa  309  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  39.79 
 
 		 437 aa  305  8.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  42.56 
 
 		 444 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  42.3 
 
 		 434 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  42.3 
 
 		 434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 443 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  42.3 
 
 		 444 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  40.1 
 
 		 451 aa  299  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  43.08 
 
 		 442 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 437 aa  297  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 428 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 442 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 428 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  41.97 
 
 		 441 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 440 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 442 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  44.82 
 
 		 433 aa  292  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 441 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4586  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 450 aa  292  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  42.56 
 
 		 434 aa  292  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 441 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 441 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 441 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 441 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  40.25 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  39.12 
 
 		 469 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 441 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3214  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 440 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  40.1 
 
 		 433 aa  282  7.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  41.32 
 
 		 456 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 		 449 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  40.1 
 
 		 433 aa  282  8.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  37.02 
 
 		 442 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  39.16 
 
 		 439 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  38.7 
 
 		 469 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  38.7 
 
 		 440 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  38.7 
 
 		 440 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  38.7 
 
 		 440 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  38.7 
 
 		 440 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  38.7 
 
 		 440 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 		 452 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  39.06 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  41.97 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  39.49 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  41.47 
 
 		 435 aa  280  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  37.63 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.38 
 
 		 439 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 443 aa  275  7e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 454 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  44.01 
 
 		 443 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  40.11 
 
 		 441 aa  273  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 436 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  41.34 
 
 		 429 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  39.48 
 
 		 445 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 442 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1431  major facilitator superfamily MFS_1  39.48 
 
 		 432 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 440 aa  269  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  38.66 
 
 		 441 aa  269  8e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  40.42 
 
 		 455 aa  268  8.999999999999999e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 		 441 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 435 aa  265  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  35.65 
 
 		 445 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1636  MFS transporter  39.38 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0261  major facilitator superfamily permease  39.38 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0172  major facilitator family transporter  39.38 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0886  major facilitator superfamily MFS_1  39.42 
 
 		 444 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 477 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 		 430 aa  263  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>