114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6017 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7426  citrate synthase-like  86.3 
 
 		 412 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0339716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5652  citrate synthase-like  100 
 
 		 416 aa  796    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6017  citrate synthase-like protein  100 
 
 		 416 aa  796    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.03442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6508  citrate synthase-like protein  95.19 
 
 		 414 aa  679    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6135  citrate synthase-like protein  85.13 
 
 		 416 aa  607  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822109  normal  0.0240059 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3155  citrate synthase-related protein  55.53 
 
 		 383 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0704  hypothetical protein  55.53 
 
 		 383 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0982036  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0125  citrate synthase-related protein  55.53 
 
 		 383 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1463  citrate synthase-related protein  55.53 
 
 		 383 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0520  citrate synthase-related protein  55.53 
 
 		 383 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2891  citrate synthase-related protein  55.53 
 
 		 383 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0538  citrate synthase-related protein  55.28 
 
 		 383 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0221269  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6702  citrate synthase  36.49 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3867  citrate synthase  28.37 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1586  methylcitrate synthase  27.45 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000154256  normal  0.49975 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4677  citrate synthase  31.07 
 
 		 257 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8311  citrate synthase  30.51 
 
 		 277 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4946  citrate synthase  27.63 
 
 		 252 aa  53.5  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.094047  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  27.66 
 
 		 385 aa  53.5  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5862  methylcitrate synthase  29.76 
 
 		 398 aa  53.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02719  methylcitrate synthase  27.66 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.966086  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0404  methylcitrate synthase  25 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00287  2-methylcitrate synthase  25 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3273  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2329  methylcitrate synthase  27.66 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00291  hypothetical protein  25 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0398  methylcitrate synthase  25 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0357  methylcitrate synthase  25 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3292  methylcitrate synthase  25 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0364  methylcitrate synthase  25 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  37.5 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.44 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1869  methylcitrate synthase  24.18 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1809  methylcitrate synthase  29.17 
 
 		 384 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1737  methylcitrate synthase  24.18 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0878  methylcitrate synthase  24.18 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1165  methylcitrate synthase  24.18 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0383  methylcitrate synthase  24.18 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679335  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0289  methylcitrate synthase  24.18 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2142  methylcitrate synthase  24.18 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4355  methylcitrate synthase  27.98 
 
 		 391 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6707  methylcitrate synthase  27.98 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3860  methylcitrate synthase  28.57 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0409  methylcitrate synthase  25.49 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027346 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0463  methylcitrate synthase  25.49 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000165686  hitchhiker  0.000000131062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0421  methylcitrate synthase  25.49 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0258062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0403  methylcitrate synthase  25.49 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0401  methylcitrate synthase  25.49 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.600733  hitchhiker  0.00000000076827 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3974  methylcitrate synthase  28.57 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0651061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4013  citrate synthase  30.34 
 
 		 274 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23220  methylcitrate synthase  26.2 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.61 
 
 		 373 aa  50.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.67 
 
 		 382 aa  50.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  27.35 
 
 		 373 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3119  citrate synthase  31.58 
 
 		 254 aa  50.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.27 
 
 		 382 aa  50.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2582  citrate synthase  36.93 
 
 		 410 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11188  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1194  citrate synthase  28.84 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2022  citrate synthase  33.15 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.275146  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2188  methylcitrate synthase  23.9 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.42 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.85 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2081  methylcitrate synthase  27.33 
 
 		 404 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847456  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0121  methylcitrate synthase  26.79 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2009  citrate synthase  29.71 
 
 		 261 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.884105 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3288  methylcitrate synthase  26.09 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281405  normal  0.014196 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4153  citrate synthase  31.55 
 
 		 284 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4041  citrate synthase  31.55 
 
 		 284 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.21 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  27.13 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4756  methylcitrate synthase  24.63 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.394349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4841  methylcitrate synthase  24.63 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.994856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5388  methylcitrate synthase  24.63 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2391  citrate synthase  32.79 
 
 		 391 aa  47.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6860  methylcitrate synthase  27.38 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632501  normal  0.17935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  22.5 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5345  methylcitrate synthase  24.26 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5516  methylcitrate synthase  24.26 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6081  methylcitrate synthase  24.62 
 
 		 389 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.662054 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2079  methylcitrate synthase  27.52 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.340874  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4959  citrate synthase  30.73 
 
 		 282 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1922  citrate synthase  35.8 
 
 		 410 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.409228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2534  citrate synthase  35.8 
 
 		 410 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0988843  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1635  methylcitrate synthase  27.52 
 
 		 386 aa  46.6  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.169583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2480  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.24 
 
 		 380 aa  46.6  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  23.81 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0115  citrate synthase 2  32 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2302  methylcitrate synthase  26.35 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.459531  normal  0.256502 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2900  methylcitrate synthase  26.35 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4144  citrate synthase  30.43 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00479182  normal  0.482128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7568  citrate synthase 2  28.57 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.47 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2558  citrate synthase  35.23 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.01047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1313  citrate synthase  29.14 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0798  citrate synthase 3  27.22 
 
 		 370 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.036744  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1039  citrate synthase  28.32 
 
 		 255 aa  44.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1097  citrate synthase family protein  31.98 
 
 		 289 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0820  2-methylcitrate synthase  27.09 
 
 		 372 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1379  citrate synthase  24.88 
 
 		 257 aa  44.3  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>