166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0437 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  100 
 
 		 179 aa  361  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  100 
 
 		 179 aa  361  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  100 
 
 		 179 aa  361  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  93.85 
 
 		 175 aa  331  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  91.06 
 
 		 176 aa  326  9e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  91.06 
 
 		 176 aa  324  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  84.36 
 
 		 178 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  80 
 
 		 175 aa  276  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  79.33 
 
 		 175 aa  269  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  79.33 
 
 		 175 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  79.33 
 
 		 175 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  77.05 
 
 		 175 aa  263  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  77.05 
 
 		 175 aa  263  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  77.05 
 
 		 175 aa  263  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  77.05 
 
 		 175 aa  263  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  71.51 
 
 		 182 aa  257  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  71.11 
 
 		 175 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  70.95 
 
 		 172 aa  251  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  55.62 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  53.3 
 
 		 170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  53.93 
 
 		 168 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  53.3 
 
 		 170 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  54.35 
 
 		 172 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  50 
 
 		 152 aa  161  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  50.87 
 
 		 164 aa  157  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0782  sec-independent translocase  50 
 
 		 159 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0330994 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  48.84 
 
 		 159 aa  156  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  49.13 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  49.14 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  46.86 
 
 		 170 aa  151  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0707  sec-independent translocase  47.13 
 
 		 155 aa  149  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114909  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  45.61 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  45.09 
 
 		 154 aa  144  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2957  sec-independent translocase  42.94 
 
 		 154 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.281897  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0117  sec-independent translocase  40.94 
 
 		 158 aa  104  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  46.3 
 
 		 120 aa  99.8  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  51.16 
 
 		 147 aa  98.6  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0116  sec-independent translocase  40.36 
 
 		 158 aa  97.4  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.579462 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  42.34 
 
 		 118 aa  96.3  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  50.56 
 
 		 149 aa  94.4  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.86 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  55 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  29.31 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  31.01 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.35 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  35.48 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.7 
 
 		 234 aa  64.7  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  48.33 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.54 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.54 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49.15 
 
 		 96 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  32.03 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  45 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.78 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  30.28 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.97 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  66.67 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.69 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  45 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.57 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  31.4 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.13 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.16 
 
 		 117 aa  53.9  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  64.1 
 
 		 110 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  35 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.68 
 
 		 116 aa  52  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.47 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.05 
 
 		 155 aa  51.2  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.93 
 
 		 159 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  34.33 
 
 		 180 aa  50.8  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  34.62 
 
 		 200 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  28.23 
 
 		 125 aa  50.8  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.86 
 
 		 157 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  32.53 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  46.67 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  29.63 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  29.46 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45470  twin arginine-targeting protein translocase  39.34 
 
 		 119 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  36.67 
 
 		 102 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  39.68 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.35 
 
 		 96 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  26.42 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  36.99 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.21 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0400  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  30.17 
 
 		 106 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  32.32 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  38.33 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0517  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.67 
 
 		 113 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.27 
 
 		 173 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  25.49 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  25.49 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.6 
 
 		 122 aa  48.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  25.49 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  25.49 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.86 
 
 		 146 aa  48.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  29.03 
 
 		 155 aa  48.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.07 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  29.63 
 
 		 182 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>