More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1317 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1317  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 353 aa  672    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10110  transcriptional regulator  55.49 
 
 		 342 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1322  transcriptional regulator, LacI family  54.65 
 
 		 336 aa  305  8.000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1083  transcriptional regulator, LacI family  52.19 
 
 		 335 aa  301  8.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0310257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1766  transcriptional regulator, LacI family  50.58 
 
 		 340 aa  301  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0293304  normal  0.0298236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1191  transcriptional regulator, LacI family  51.17 
 
 		 336 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2988  transcriptional regulator, LacI family  51.9 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0414  regulatory protein LacI  51.32 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2169  transcriptional regulator, LacI family  45.09 
 
 		 337 aa  253  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5557  transcriptional regulator, LacI family  45.86 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.634318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4934  transcriptional regulator, LacI family  45.64 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.129155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2405  LacI family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 333 aa  246  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.475476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1296  LacI family transcription regulator  43.03 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4675  transcriptional regulator, LacI family  42.49 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1842  transcriptional regulator, LacI family  41.47 
 
 		 323 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2612  transcriptional regulator, LacI family  37.72 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13620  transcriptional regulator  38.12 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3464  LacI family transcription regulator  36.99 
 
 		 340 aa  190  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4931  transcriptional regulator, LacI family  39.83 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.699714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01800  transcriptional regulator  36.29 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6905  transcriptional regulator, LacI family  36.09 
 
 		 334 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00908765  hitchhiker  0.00367965 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  32.76 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3594  transcriptional regulator, LacI family  36.25 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3601  transcriptional regulator, LacI family  36.71 
 
 		 358 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  35.43 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0384  regulatory protein LacI  34.41 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.899866  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17790  transcriptional regulator  46.86 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255976  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1061  LacI family response repressor  29.79 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.023904  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  30.03 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0183  transcriptional regulator, LacI family  32.42 
 
 		 344 aa  122  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  28.24 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01470  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4583  transcriptional regulator, LacI family  31.85 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0718425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  29.83 
 
 		 339 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2354  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756754  normal  0.112701 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  26.71 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  27.25 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  31.6 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  31.81 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  30.68 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  31.7 
 
 		 339 aa  112  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0544  LacI family transcription regulator  29.57 
 
 		 335 aa  112  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1802  transcriptional regulator, LacI family  31.7 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5484  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  32.09 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4929  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33528  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05320  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3199  LacI family transcription regulator  33.52 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.13351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  29.55 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1119  LacI family transcription regulator  32.76 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140598 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  34.07 
 
 		 663 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6022  LacI family transcription regulator  33.74 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  31.44 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0736  transcriptional regulator, LacI family  32.35 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.948547 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  30.64 
 
 		 353 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6322  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  26.32 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07090  transcriptional regulator  32.07 
 
 		 344 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.72012 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  26.32 
 
 		 332 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  25.94 
 
 		 332 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0495  LacI family transcription regulator  31.82 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  24.64 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  26.32 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  26.32 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  30.77 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  30.42 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  26.01 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  26.01 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  26.01 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4882  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  27.57 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3283  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3585  LacI family transcription regulator  24.77 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000546261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  26.01 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  26.01 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0617  transcriptional regulator, LacI family  32.18 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3709  galactose operon repressor  25.53 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  31.53 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  27.61 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1812  LacI family transcription regulator  27.22 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000564911  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3013  transcriptional regulator, LacI family  31.62 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2753  transcriptional regulator, LacI family  31.86 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  27.61 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  27.61 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  27.61 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  27.61 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  27.61 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  27.61 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  29.55 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  28.07 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  26.88 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  26.36 
 
 		 338 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  27.3 
 
 		 340 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  26.17 
 
 		 332 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  27.81 
 
 		 343 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  31.2 
 
 		 357 aa  99.8  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  25.31 
 
 		 332 aa  100  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  29.61 
 
 		 340 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  31.16 
 
 		 340 aa  99.4  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  32.1 
 
 		 341 aa  99.4  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>