More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0488 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0488  30S ribosomal protein S10  100 
 
 
103 aa  205  2e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.149423  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0766  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 
102 aa  152  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000754172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 
102 aa  141  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 
101 aa  139  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 
101 aa  139  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 
101 aa  139  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 
101 aa  139  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1225  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 
123 aa  137  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00268366  unclonable  0.00000899576 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  63.73 
 
 
103 aa  137  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  65.98 
 
 
102 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 
102 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 
103 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  58.82 
 
 
104 aa  134  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 
103 aa  134  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 
103 aa  134  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  61.39 
 
 
107 aa  134  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  63.92 
 
 
102 aa  134  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 
103 aa  134  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 
103 aa  134  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4006  ribosomal protein S10  62.89 
 
 
102 aa  133  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232097  normal  0.70609 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  63.37 
 
 
102 aa  133  7.000000000000001e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  133  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  61.76 
 
 
103 aa  132  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  57.84 
 
 
104 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  62.89 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  62.89 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  62.89 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  62.89 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  62.89 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  62.89 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  59.79 
 
 
103 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  62.89 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  59.79 
 
 
103 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  64.95 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  60.82 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  64.95 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000558853  hitchhiker  0.0000000000000328358 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  57.43 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0255  30S ribosomal protein S10  57.84 
 
 
104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000004332  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4916  30S ribosomal protein S10  57.84 
 
 
104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0202  30S ribosomal protein S10  57.84 
 
 
104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253656  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1263  30S ribosomal protein S10  57.43 
 
 
103 aa  131  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  58.76 
 
 
102 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  60.82 
 
 
102 aa  131  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  58.76 
 
 
102 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  61.86 
 
 
102 aa  131  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  58.82 
 
 
103 aa  131  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  57.43 
 
 
103 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  59.79 
 
 
104 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  58.42 
 
 
102 aa  130  5e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0961  ribosomal protein S10  60.4 
 
 
102 aa  130  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000260411  hitchhiker  0.000000000152054 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10030  SSU ribosomal protein S10P  60.4 
 
 
102 aa  130  5e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000017716  hitchhiker  0.00000000188362 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  58.59 
 
 
104 aa  130  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0582  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
103 aa  130  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  59.41 
 
 
102 aa  130  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  63.92 
 
 
102 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  63.92 
 
 
102 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0707  ribosomal protein S10  64.95 
 
 
101 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00179336  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2439  30S ribosomal protein S10  61.86 
 
 
102 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2122  30S ribosomal protein S10  61.86 
 
 
102 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.854148  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2161  30S ribosomal protein S10  61.86 
 
 
102 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4342  30S ribosomal protein S10  62.89 
 
 
101 aa  130  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0589307  normal  0.109776 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1353  30S ribosomal protein S10  61.86 
 
 
102 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.777643  normal  0.0177608 
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  60.82 
 
 
102 aa  129  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1907  30S ribosomal protein S10  59.79 
 
 
102 aa  129  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000187857  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  60.82 
 
 
102 aa  129  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  60.82 
 
 
102 aa  129  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0354  30S ribosomal protein S10  59.79 
 
 
102 aa  129  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1186  30S ribosomal protein S10  57.43 
 
 
102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.376062  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0275  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  62.89 
 
 
102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0714  ribosomal protein S10  57.43 
 
 
102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0980  ribosomal protein S10  59.41 
 
 
106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.604539  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  60.82 
 
 
102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2066  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 
105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000145478  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0665  ribosomal protein S10  59.79 
 
 
102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232715  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  58.42 
 
 
102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  58.76 
 
 
102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  59.79 
 
 
102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0581  30S ribosomal protein S10  60.82 
 
 
102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0476  ribosomal protein S10  58.59 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0110  30S ribosomal protein S10  59.41 
 
 
102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000437851  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0766  30S ribosomal protein S10  58.76 
 
 
102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300244  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0697  ribosomal protein S10  59.79 
 
 
102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000581864  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  59.79 
 
 
102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0106  30S ribosomal protein S10  59.41 
 
 
102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 
102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 
102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  59.79 
 
 
102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0758  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389687  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3645  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000475308  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2633  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000272648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0121  30S ribosomal protein S10  59.41 
 
 
102 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5859e-62 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3777  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000424797  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3069  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998747  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0313  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000233009  normal  0.0207604 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3805  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00677019  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0347  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0012099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0718  30S ribosomal protein S10  59.38 
 
 
103 aa  128  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000141431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>