More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6018 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6018  threonine dehydratase  100 
 
 		 323 aa  628  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5774  threonine dehydratase  96.59 
 
 		 323 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6145  threonine dehydratase  87 
 
 		 323 aa  552  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5805  threonine dehydratase  90.09 
 
 		 323 aa  544  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6169  threonine dehydratase  90.09 
 
 		 323 aa  544  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0794807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6650  threonine dehydratase  89.16 
 
 		 323 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.987033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3864  threonine dehydratase  69.97 
 
 		 330 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0056  threonine dehydratase  70.15 
 
 		 344 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595  hitchhiker  0.00751641 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2151  threonine dehydratase  71.84 
 
 		 319 aa  401  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3469  threonine dehydratase  60.44 
 
 		 324 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4376  ectoine utilization protein EutB  64.06 
 
 		 325 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4430  threonine dehydratase  56.04 
 
 		 330 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5519  threonine dehydratase  60.33 
 
 		 333 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0114285 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5240  threonine dehydratase  57.99 
 
 		 333 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3695  threonine dehydratase  56.43 
 
 		 334 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000638  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme beta subunit  49.34 
 
 		 324 aa  272  7e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0285  threonine dehydratase  54.37 
 
 		 318 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.832074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2723  threonine dehydratase  51.75 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  42.5 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  42.81 
 
 		 403 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3175  threonine dehydratase  56.72 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.465407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  38.05 
 
 		 403 aa  215  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  38.02 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  36.77 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  43.44 
 
 		 403 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  35.48 
 
 		 403 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  42.81 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  43.12 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  35.81 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  34.91 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  43.12 
 
 		 410 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  42.5 
 
 		 403 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  44.73 
 
 		 358 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  37.03 
 
 		 400 aa  199  7.999999999999999e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  37.42 
 
 		 402 aa  198  9e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  42.99 
 
 		 415 aa  198  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  36.39 
 
 		 403 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  42.9 
 
 		 402 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  42.71 
 
 		 506 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  42.71 
 
 		 506 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  39 
 
 		 514 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  35.91 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  40.58 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.82 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  35.42 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  33.23 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  39.23 
 
 		 503 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  33.23 
 
 		 402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  41.85 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  44.05 
 
 		 404 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  39.75 
 
 		 401 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  39.75 
 
 		 401 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  41.02 
 
 		 501 aa  189  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  39.42 
 
 		 402 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1763  threonine dehydratase, biosynthetic  41.86 
 
 		 512 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  35.51 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  36.13 
 
 		 511 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.48 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  39.23 
 
 		 403 aa  185  7e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  39.86 
 
 		 507 aa  185  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  34.66 
 
 		 408 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  42.17 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2260  threonine dehydratase  36.66 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00014617  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  38.93 
 
 		 507 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  38.16 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2486  threonine dehydratase  36.66 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  39.2 
 
 		 526 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2297  threonine dehydratase  36.33 
 
 		 333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2469  threonine dehydratase  36.33 
 
 		 333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4230  threonine dehydratase  43.96 
 
 		 412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0941557  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  37.29 
 
 		 509 aa  182  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.01 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2502  threonine dehydratase  36.33 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  40.99 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2218  threonine dehydratase  36.33 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  38.34 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  35.31 
 
 		 401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  38.54 
 
 		 504 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  38.54 
 
 		 504 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  38.98 
 
 		 408 aa  180  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  38.57 
 
 		 418 aa  179  4e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2749  serine/threonine dehydratase  35.35 
 
 		 329 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976068  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  40.2 
 
 		 507 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2565  threonine dehydratase  36.01 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0373564  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  38.36 
 
 		 527 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2424  threonine dehydratase  36.33 
 
 		 333 aa  179  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  40.28 
 
 		 412 aa  179  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0303  threonine dehydratase  38.19 
 
 		 565 aa  179  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0613066  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  36.3 
 
 		 395 aa  178  9e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  38.21 
 
 		 515 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2925  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  39.94 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.412032 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  41.03 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  37.05 
 
 		 549 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  35.31 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  39.39 
 
 		 520 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  39.01 
 
 		 415 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2906  threonine dehydratase  36.01 
 
 		 333 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  38.16 
 
 		 503 aa  175  8e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  37.54 
 
 		 509 aa  175  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  38.78 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>