69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5938 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5938  transport-associated  100 
 
 		 124 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483865  normal  0.018454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  44.54 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2480  transport-associated protein  53.52 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  50.7 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225437 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  45.45 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  45.45 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3270  transport-associated  41.28 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21303  normal  0.821762 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  44.57 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0383  phospholipid binding protein  38.74 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1419  transport-associated domain-containing protein  48.61 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  45.83 
 
 		 221 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  45.95 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  45.83 
 
 		 221 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0885  transport-associated domain-containing protein  45.83 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3185  transport-associated domain-containing protein  45.83 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0627443  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1891  putative phospholipid-binding protein  45.83 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944608  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  45.83 
 
 		 294 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3201  phospholipid-binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 221 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1716  periplasmic phospholipid binding protein  38.74 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.547226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  39.45 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  43.06 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  36.08 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  35.56 
 
 		 118 aa  57  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  38.14 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5747  hypothetical protein  39.25 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.401679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  37.14 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  44.19 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  44.19 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  44.19 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2545  transport-associated protein  36.36 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.899169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  38.89 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6500  hypothetical protein  36.45 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.193571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  36.04 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0799  transport-associated  43.94 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0839  transport-associated  41.79 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0356  transport-associated  41.79 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29049  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0811  transport-associated  41.79 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  40.58 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  35.35 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5640  transport-associated  35.78 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3931  transport-associated protein  38.81 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0118237 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  32.35 
 
 		 295 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  36 
 
 		 276 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  39.71 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  37.14 
 
 		 226 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  41.67 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  31.63 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  41.67 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  41.67 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  30.11 
 
 		 220 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  32.14 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  33.63 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  41.67 
 
 		 204 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  33.33 
 
 		 309 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4984  transport-associated  32.29 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0812534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4490  transport-associated  40.3 
 
 		 278 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  31.15 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  30.09 
 
 		 233 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  38 
 
 		 217 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  38.24 
 
 		 197 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4342  hypothetical protein  33.82 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  38.24 
 
 		 216 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  41.82 
 
 		 273 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  38.24 
 
 		 216 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  38.24 
 
 		 216 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  38.24 
 
 		 216 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  38.24 
 
 		 216 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5837  hypothetical protein  33.82 
 
 		 125 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5023  hypothetical protein  33.82 
 
 		 125 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>