48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4950 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  98.72 
 
 		 235 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0020  hypothetical protein  92.34 
 
 		 234 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4557  hypothetical protein  91.06 
 
 		 235 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0500277  normal  0.141352 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5678  hypothetical protein  90.64 
 
 		 235 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  hitchhiker  0.00182572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5181  hypothetical protein  90.64 
 
 		 235 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3176  hypothetical protein  89.66 
 
 		 234 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2358  hypothetical protein  81.33 
 
 		 235 aa  337  8e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493122  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1489  hypothetical protein  81.33 
 
 		 235 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3160  hypothetical protein  80.8 
 
 		 225 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2099  hypothetical protein  80 
 
 		 235 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3274  hypothetical protein  80.36 
 
 		 225 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2393  hypothetical protein  79.91 
 
 		 225 aa  321  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1128  hypothetical protein  79.91 
 
 		 225 aa  321  7e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1408  hypothetical protein  79.91 
 
 		 225 aa  321  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.6284  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0013  hypothetical protein  71.11 
 
 		 243 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7030  hypothetical protein  72 
 
 		 243 aa  307  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208747  hitchhiker  0.0000000103187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4136  hypothetical protein  68.86 
 
 		 237 aa  290  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  47.12 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  44.2 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3157  hypothetical protein  44.39 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7159  hopanoid-associated phosphorylase  41.89 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5427  hypothetical protein  42.06 
 
 		 258 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.103702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  42.34 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  40.85 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6343  hypothetical protein  41.28 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  36.77 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  36.67 
 
 		 246 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  39.91 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  36.74 
 
 		 276 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  40.85 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  38.68 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  37.26 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  39.77 
 
 		 216 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  38.8 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  42.86 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  34.07 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  41.62 
 
 		 242 aa  89.4  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  33.64 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  36.25 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1782  hopanoid-associated phosphorylase  34.62 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2123  MTA/SAH nucleosidase, putative  34.62 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2078  nucleoside phosphorylase, putative  32.57 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0811  phosphorylase family protein  34.27 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.120801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20750  Purine and other phosphorylase-like protein, family 1  36.24 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10092  bifunctional 5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.92 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.520049  normal  0.244125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1662  hypothetical protein  24.67 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0361  5'-methylthioadenosine phosphorylase  28.24 
 
 		 294 aa  42.4  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>