More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4592 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  100 
 
 		 321 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  91.9 
 
 		 321 aa  613  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  91.28 
 
 		 321 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  91.28 
 
 		 321 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  90.34 
 
 		 321 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  90.03 
 
 		 321 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  59.43 
 
 		 322 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  60.44 
 
 		 321 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  59.5 
 
 		 323 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  61.49 
 
 		 322 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  59.94 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  57.63 
 
 		 320 aa  371  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  54.49 
 
 		 322 aa  368  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  57.37 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  56.73 
 
 		 316 aa  361  8e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  56.73 
 
 		 316 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  55.77 
 
 		 316 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  55.97 
 
 		 325 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  56.01 
 
 		 315 aa  352  4e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  52.53 
 
 		 316 aa  341  9e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  52.53 
 
 		 316 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  53.48 
 
 		 317 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  55.56 
 
 		 317 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  55.56 
 
 		 317 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  51.71 
 
 		 319 aa  325  8.000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  48.75 
 
 		 320 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  51.71 
 
 		 319 aa  309  4e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  50.16 
 
 		 323 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  49.05 
 
 		 315 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  47.35 
 
 		 319 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  49.2 
 
 		 320 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  50.47 
 
 		 332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  47.98 
 
 		 344 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  46.86 
 
 		 318 aa  293  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  48.42 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  51.59 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2173  vanillate O-demethylase oxidoreductase  45.48 
 
 		 320 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  46.54 
 
 		 331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  45.03 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  42.72 
 
 		 318 aa  275  9e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  44.86 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  48.1 
 
 		 324 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  45.93 
 
 		 326 aa  268  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  44.21 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  40.92 
 
 		 330 aa  258  8e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  43.48 
 
 		 320 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  47.52 
 
 		 319 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2111  ferredoxin-oxidoreductase FAD/NAD(P)- binding, ring hydroxylating dioxygenase reductase subunit  44.21 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2150  ferredoxin  44.34 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  44.38 
 
 		 316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  44.38 
 
 		 316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.44 
 
 		 318 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  44.48 
 
 		 784 aa  250  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  40 
 
 		 322 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  41.01 
 
 		 320 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  44.38 
 
 		 322 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  41.01 
 
 		 320 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  45.4 
 
 		 321 aa  248  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5676  ferredoxin  44.51 
 
 		 323 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0301762  normal  0.0416479 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5899  ferredoxin  44.51 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.985129  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  40.75 
 
 		 588 aa  245  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  43.44 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  40.75 
 
 		 788 aa  239  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  42.14 
 
 		 325 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3141  ferredoxin  44.06 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  39.13 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3566  ferredoxin  42.99 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  41.67 
 
 		 330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5138  ferredoxin  43.25 
 
 		 325 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  43.56 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  41.96 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  40.19 
 
 		 320 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  40.67 
 
 		 319 aa  233  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  41.88 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  42.27 
 
 		 318 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  43.93 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  40.8 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  41.88 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  39.25 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  42.63 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  41.25 
 
 		 326 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  41.46 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  43.41 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  42.86 
 
 		 783 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  43.51 
 
 		 784 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  43.18 
 
 		 784 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  41.43 
 
 		 318 aa  222  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  43.18 
 
 		 784 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  43.18 
 
 		 784 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  43.18 
 
 		 784 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  43.18 
 
 		 784 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  43.18 
 
 		 784 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  39.44 
 
 		 317 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  40.18 
 
 		 333 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  40.18 
 
 		 333 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  38.53 
 
 		 321 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5962  ferredoxin  41.56 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0118173 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  38.53 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2680  ferredoxin  40.79 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  38.23 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>