258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4525 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 143 aa  296  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  97.9 
 
 		 143 aa  291  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  81.56 
 
 		 143 aa  244  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  79.43 
 
 		 143 aa  243  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  79.43 
 
 		 143 aa  243  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  78.01 
 
 		 143 aa  238  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  80 
 
 		 145 aa  236  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  75.18 
 
 		 144 aa  230  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  77.14 
 
 		 145 aa  228  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  73.53 
 
 		 143 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  73.72 
 
 		 141 aa  215  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  72.99 
 
 		 140 aa  210  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  68.57 
 
 		 145 aa  208  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  68.57 
 
 		 145 aa  208  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  68.57 
 
 		 145 aa  208  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  68.57 
 
 		 145 aa  208  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  69.57 
 
 		 246 aa  207  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  69.57 
 
 		 243 aa  207  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  70.29 
 
 		 145 aa  207  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  68.31 
 
 		 141 aa  207  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  71.53 
 
 		 140 aa  206  7e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  67.86 
 
 		 145 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  75.81 
 
 		 141 aa  200  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  75.81 
 
 		 141 aa  200  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  65.96 
 
 		 138 aa  196  7e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  71.2 
 
 		 140 aa  191  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  63.77 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  65.03 
 
 		 142 aa  186  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  62.86 
 
 		 143 aa  183  6e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  57.97 
 
 		 139 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  57.97 
 
 		 139 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  60.28 
 
 		 279 aa  176  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  57.34 
 
 		 146 aa  175  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  64.23 
 
 		 284 aa  173  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  58.7 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  58.04 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  54.93 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  59.29 
 
 		 140 aa  163  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  66.12 
 
 		 122 aa  163  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  57.03 
 
 		 144 aa  151  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  53.68 
 
 		 391 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  56.62 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  60.83 
 
 		 137 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  55.15 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  59.17 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  52.55 
 
 		 139 aa  144  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  58.33 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  58.33 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  58.33 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  58.33 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  58.33 
 
 		 137 aa  141  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  57.5 
 
 		 137 aa  139  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  57.5 
 
 		 137 aa  139  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  57.5 
 
 		 137 aa  139  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  52.14 
 
 		 146 aa  139  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  57.5 
 
 		 137 aa  139  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  59.52 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  55.38 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  55.65 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  50 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  55.83 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  54.17 
 
 		 140 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  55 
 
 		 139 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  55 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  55 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  55 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  55.83 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  53.91 
 
 		 137 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  52.5 
 
 		 137 aa  124  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  50 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  47.54 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 261 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  48.06 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  47.5 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  48.76 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  43.59 
 
 		 135 aa  103  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  43.61 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  41.3 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  41.67 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  44.17 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  42.5 
 
 		 138 aa  97.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  48.51 
 
 		 138 aa  97.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  39.57 
 
 		 140 aa  97.1  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  42.86 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  42.15 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  40 
 
 		 154 aa  90.1  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0077  YCII-related  38.24 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.35045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  41.67 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  40.34 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  40.34 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  40.34 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3319  YCII-related  36.51 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  42.31 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  40.91 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  30.77 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0283  YCII-related protein  36.67 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  37.35 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  34.07 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5265  YCII-related  39.62 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>