162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4294 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 99 aa  202  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  95.96 
 
 		 99 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  81.82 
 
 		 99 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5952  antibiotic biosynthesis monooxygenase  80.81 
 
 		 99 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49186  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  79.8 
 
 		 99 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  79.8 
 
 		 99 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  81.82 
 
 		 99 aa  153  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1144  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.96 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  0.57363 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  40.43 
 
 		 101 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  36.56 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.79 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  36.59 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  34.15 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2308  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.73 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  36.9 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  32.93 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.25 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  30.49 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  30.49 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  30.49 
 
 		 97 aa  57  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  30.49 
 
 		 97 aa  57  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  30.49 
 
 		 97 aa  57  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  31.71 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  36.99 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  36.99 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.29 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  35 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.22 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.22 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.87 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.22 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.44 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.44 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.35 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10140  hypothetical protein  39.51 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.1 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.73 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2164  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142166  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  38.1 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0873  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.66 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  31.94 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.85 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.88 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.88 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  29.03 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 		 96 aa  48.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.45 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.4 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.62 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.06 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.87 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.33 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39960  hypothetical protein  36.51 
 
 		 254 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.228774  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.33 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.33 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.4 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0549  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.09 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.91 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.59 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  30.67 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  30.67 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.4 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  28.57 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  31.46 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.03 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  28.57 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.32 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2595  hypothetical protein  41.03 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  28.38 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.97 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  28.72 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.53 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.87 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>