More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1646 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0270  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  99.69 
 
 
324 aa  658    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1646  putative dehydratase  100 
 
 
326 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  99.38 
 
 
324 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0205  hypothetical protein  92.64 
 
 
325 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.43 
 
 
301 aa  179  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 
307 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 
307 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 
307 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.56 
 
 
308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
324 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0618  oligopeptide transporter OPT  24.04 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.41 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.165697  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.81 
 
 
317 aa  67  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.38 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01321  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  25.49 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0592  capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0223  putative nucleotide sugar epimerase  26.27 
 
 
340 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02926  nucleotide sugar epimerase  26.59 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.11 
 
 
335 aa  63.5  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0191  putative nucleotide sugar epimerase  31.58 
 
 
339 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.068357  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
330 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  25.74 
 
 
337 aa  63.9  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12841  putative nucleotide sugar epimerase  23.21 
 
 
345 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.363741  normal  0.0780964 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.95 
 
 
328 aa  63.5  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 
318 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
336 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.93 
 
 
335 aa  63.2  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4099  hypothetical protein  24.46 
 
 
334 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.104495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.53 
 
 
356 aa  62.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3886  UDP-glucuronate 5'-epimerase  25.35 
 
 
335 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3979  UDP-glucuronate 5'-epimerase  25 
 
 
335 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.66 
 
 
327 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0033  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.48 
 
 
365 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25381  putative nucleotide sugar epimerase  30.53 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2598  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 
325 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1011  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.49 
 
 
336 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000399652  decreased coverage  0.0000579035 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0038  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.31 
 
 
336 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1313  putative nucleotide sugar epimerase  21.84 
 
 
355 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.340796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.48 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.43 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 
324 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.6 
 
 
320 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
337 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.06 
 
 
330 aa  60.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.31 
 
 
321 aa  60.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000491095  unclonable  4.61706e-23 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0609  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.86 
 
 
337 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
335 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 
336 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.57 
 
 
327 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.94 
 
 
362 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.36 
 
 
327 aa  59.7  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
324 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 
330 aa  59.7  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0450  WbnF  25.48 
 
 
355 aa  60.1  0.00000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
336 aa  60.1  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
341 aa  59.7  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
373 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
335 aa  59.7  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 
353 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.316579 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  23 
 
 
334 aa  59.3  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
336 aa  59.3  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2449  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  26.29 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0862725  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179561  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6255  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.27 
 
 
353 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849165  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4095  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.37 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.59701  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.37 
 
 
334 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.64 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000773597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.11 
 
 
335 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.59 
 
 
354 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2638  UDP-glucuronate 5'-epimerase  24.21 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.89 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0025  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.65 
 
 
338 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.730827  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.54 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1136  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  27.27 
 
 
360 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0311464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5221  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.79 
 
 
355 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13711  putative nucleotide sugar epimerase  21.11 
 
 
345 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.365086  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.78 
 
 
358 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.25 
 
 
299 aa  57  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.17 
 
 
355 aa  57  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>